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DNA“甲基化指紋”鑒定出91種腫瘤
科技日報北京3月18日電英國《自然》雜誌近日線上發表了一項癌症研究成果,歐洲科學家研發了一種全新機器學習程式,通過DNA甲基化數據——“甲基化指紋”科技可以改善腦腫瘤的診斷。研究團隊開發出來的程式經過訓練後,可以使用“甲基化指紋”鑒定91種
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日本團隊開發出用少量DNA即可解析長鏈DNA甲基化的方法
東京大學鈴木穰教授等開發了僅用少量DNA即可對長鏈DNA甲基化進行解析的方法。採用該方法僅需10納克左右DNA便能對與疾病、發育或分化相關的甲基化狀況進行分析。在實驗中,研究團隊使用上述方法對乳腺癌臨床標本的大約25納克DNA進行了分析,結
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中國科學院生物物理研究所朱冰課題組發展了能檢測DNA甲基化維持效率的研究方法(Hammer-seq)
在Hammer-seq的開發過程中,該方法也在本課題組和清華大學頡偉課題組的一項合作工作中得到了應用。
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Nature子刊,|,浙江大學劉琬璐等團隊用甲基轉移酶异比特靶向擬南芥中CG,DNA甲基化
將錶觀遺傳標記靶向特定位點的能力在基礎研究和作物植物工程中都很重要。但是,靶向DNA甲基化的遺傳性,其如何影響基因表達以及正確建立所需的錶觀遺傳特徵尚不清楚。在擬南芥中,DNA甲基化發生在三個序列環境中:CG,CHG和CHH。植物中DNA甲
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連發2篇Science,|,美國科學院院士Jacobsen揭示DNA甲基化與基因沉默的新機制
DNA甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關,但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。事實上,該研究發現SILENZIO的保守J域基序是其與HSP70相互作用及其沉默功能所必需的。這些結果揭示了分子伴侶J結構域蛋白在DNA甲基化下游的基因
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【Science,】連發兩篇!植物DNA甲基化增强/抑制基因表達的分子機制
DNA甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關,但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。來自美國加州大學洛杉磯分校StevenE.Jacobsen課題組在2018年和2021年連續發表了兩篇Science文章,揭示了植物DNA甲基化促進/抑
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JCI,湯富酬/喬傑團隊利用DNA甲基化追溯囊胚培養液中游離DNA細胞來源
部分流產胚胎主要是源於胚胎的非整倍體染色體異常,在移植胚胎前鑒定並排除非整倍體胚胎是輔助生殖領域面臨的巨大挑戰。以檢測體外培養胚胎的培養液中游離DNA為代表的無創植入前胚胎遺傳學檢測,因沒有對胚胎本身進行取樣操作,能够避免上述問題,但無創檢
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Nature子刊,生於憂患、死於安樂,刺激的環境,會讓大腦保持年輕
2000多年前,孟子就曾說過——生於憂患、死於安樂。通過單核苷酸分辯率的全基因組DNA甲基化測序,證明了高刺激環境還能恢復大腦海馬中大量與年齡相關的DNA甲基化變化,表明高刺激環境能够使大腦的記憶控制中心海馬體保持年輕。
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Science,Advances/PJ,|,張秀任/郎曌博/何新建連發3篇,揭示FVE在調控siRNA及DNA甲基化的關鍵作用
在植物中,從頭DNA甲基化主要通過RNA介導的DNA甲基化途徑發生。儘管在錶觀遺傳水准上具有充分表徵的功能,但FVE在PTGS中的參與和機制功能尚不清楚。FVE促進SGS3同源二聚化,這對其功能至關重要。囙此,這項研究揭示了FVE在PTGS
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香港中文大學陳偉儀教授課題組Advanced,Science封面故事,哺乳動物中被遺落的DNA,non-CG甲基化
DNA甲基化是基因表觀遺傳學的重要機制之一,參與調控基因表達和細胞分化。以往哺乳動物中出現的低頻non-CG甲基化被認為是人為造成的,它的作用長期被忽視。已知在小鼠胚胎發育過程中,Pten缺失會引起胚胎致死。陳偉儀教授團隊發現Pten缺失通
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分子植物中心朱健康研究組揭示維持DNA甲基化和基因組穩定的新機制
因而,生物個體是如何維持跳躍基因上面緻密的DNA甲基化修飾一直是錶觀遺傳領域中重要的研究方向。在植物中,多種DNA甲基化調控通路合作維持不同基因組位置的跳躍基因上緻密的DNA甲基化狀態。
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分子植物卓越中心郎曌博研究組揭示新的RdDM通路的分子機制
RdDM可以在轉錄水准抑制轉座子和基因,並參與到植物生物和非生物脅迫、植株再生、植物生長和果實成熟發育等生物學調控過程。在本研究中,科研人員通過全基因組甲基化測序以及差异甲基化區域分析發現,開花調控基因FVE能够影響部分RdDM通路調控位點
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中南大學王建新教授團隊在DNA甲基化檢測研究中取得重要進展
DNA甲基化是表觀遺傳學中的一個重要研究問題,其在染色質結構和組織水准上的生物過程中起主要作用。
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清華生命學院頡偉課題組發文揭示DNA甲基化通過去記憶化構建早期胚胎發育的錶觀屏障
早期胚胎發育起始於高度特化的精子和卵子的結合,從而形成全能性的受精卵。研究結果表明,哺乳動物早期胚胎發育過程中DNA甲基化會在全基因組範圍內發生顯著的“擦除-重建”過程。與此截然不同的是,斑馬魚和非洲爪蟾蜍等非哺乳動物早期胚胎發育過程中全基
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營養與健康所Andrew,Teschendorff研究組建立高解析度DNA甲基化圖譜,首次在多種組織中實現單細胞分辯率下錶觀基因組關聯研究
人體的衰老和某些致病因素(如肥胖)會導致DNA甲基化變異,從而導致疾病的發生,研究DNA甲基化變異對認知疾病機理有重要意義。然而,現有的DNA甲基化檢測科技通常取樣於大塊組織,是多種細胞的混合物,因而無法測得每種細胞類型的DNA甲基化水准。
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