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標籤聚合:甲基
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甲基
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DNA“甲基化指紋”鑒定出91種腫瘤
科技日報北京3月18日電英國《自然》雜誌近日線上發表了一項癌症研究成果,歐洲科學家研發了一種全新機器學習程式,通過DNA甲基化數據——“甲基化指紋”科技可以改善腦腫瘤的診斷。研究團隊開發出來的程式經過訓練後,可以使用“甲基化指紋”鑒定91種
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腫瘤
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癌症
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dna
dna甲基化
研究人員揭示超級增强子動態甲基化調控轉錄異質性
研究人員選擇了Sox2和miR290-295的超級增强子作為研究對象。而且由於Sox2和miR290的表達位置不同,在MIR290-SE-TG小鼠中滋養層的miR290超級增强子甲基化也是異質性的。該研究系統第一次實时在單細胞和單染色體水准
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甲基
異質性
動態
科學
科普
調控
日本團隊開發出用少量DNA即可解析長鏈DNA甲基化的方法
東京大學鈴木穰教授等開發了僅用少量DNA即可對長鏈DNA甲基化進行解析的方法。採用該方法僅需10納克左右DNA便能對與疾病、發育或分化相關的甲基化狀況進行分析。在實驗中,研究團隊使用上述方法對乳腺癌臨床標本的大約25納克DNA進行了分析,結
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甲基
dna
科學
科普
dna甲基化
狗吃多少巧克力會中毒
有些狗在攝入巧克力之後並沒有出現問題,甚至連不良反應都沒有,照常吃喝玩樂!難道這些狗吃的是假巧克力?因為巧克力中的咖啡因和可哥堿這兩種物質都是甲基黃嘌呤家族的成員。巧克力越黑,則代表甲基黃嘌呤含量越高。還有些狗吃了巧克力沒任何反應的一個重要
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黃嘌呤
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巧克力
可哥粉
中國科大在三氟甲基連續可控脫氟轉化領域取得重要進展
中國科學技術大學汪義豐教授研究團隊和合作者發展了一種三氟甲基逐級可控脫氟官能團化反應。北京时間3月5日,國際著名學術期刊《科學》雜誌以“FirstRelease”形式線上發佈了該項工作。該局限性嚴重阻礙了三氟甲基脫氟官能團化反應的發展。
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甲基
中國科學院生物物理研究所朱冰課題組發展了能檢測DNA甲基化維持效率的研究方法(Hammer-seq)
在Hammer-seq的開發過程中,該方法也在本課題組和清華大學頡偉課題組的一項合作工作中得到了應用。
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甲基
科學
中國科學院
dna
科普
dna甲基化
中國科學院生物物理研究所葉克窮課題組在擬南芥RNA,核糖甲基化修飾研究上取得新進展
論文系統檢測了模式植物擬南芥中多種RNA上的2'氧甲基化修飾譜,並對指導修飾的snoRNA進行了歸屬。大部分RNA在轉錄後都會發生化學修飾,其中核糖2'比特甲基化是頻率最高的修飾之一。總之,該研究揭示擬南芥三種類型rRNA和
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擬南芥
甲基
科學
科普
廈門大學藥學院劉文教授團隊發文Nature子刊,揭示精氨酸甲基化修飾網絡及有關促癌機制
精氨酸甲基化修飾分為單甲基化、對稱性雙甲基化和非對稱性雙甲基化修飾。大量研究報導了I型和II型PRMT的甲基化修飾底物的鑒定,但唯一一個III型PRMT成員PRMT7的底物及其與I型和II型PRMT的底物的關係仍是未知。基於所鑒定到的甲基化
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甲基
精氨酸
同濟大學理學院張揚會課題組在碳酸二甲酯參與的串聯甲基化反應研究中取得重要進展,相關成果發表於美國化學會志(JACS)
甲基是小分子藥物裡面非常常見的基團,它可以改變分子的構象,改善藥物的溶解性,增强代謝穩定性以及生物活性等,這種效應被稱為“甲基效應”。因為“甲基效應”的存在,發展高效的甲基化反應以及綠色甲基化試劑成是有機合成化學的重要目標。
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碳酸二甲酯
甲基
武漢植物園揭示了水生植物蓮兩生態型間錶型適應性分化的表觀遺傳學機制
特色水生經濟植物蓮其自然分佈區包括兩種分別適應高低緯度氣候環境的生態型:溫帶型和熱帶型。DNA甲基化修飾是一類重要的錶觀遺傳修飾,其中胞嘧啶殘基第5比特碳原子上的甲基化現象是研究最廣泛的錶觀遺傳修飾。然而,可能影響蓮兩生態型地下莖錶型適應性
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甲基
植物
表觀遺傳學
金屬所開發鎳/碳複合電極實現5-羥甲基糠醛高效電重整過程
5-羥甲基糠醛作為生物質資源的重要代表性平臺產品之一,可以作為原料生產多種高附加值化合物。日前,金屬所瀋陽材料科學國家研究中心能源催化資料課題組齊偉研究員團隊提出通過電沉積科技將鎳以納米片的形式均勻生長在碳紙基底上製備複合電極資料,並利用該
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糠醛
甲基
科學
納米
科普
中科院陳策實課題組發現PRMT5甲基化KLF5促進基底型乳腺癌發生發展
該研究使檢測PRMT5的表達水准的异常升高具有可以作為基底型乳腺癌患者預後標誌物的可能性。
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乳腺癌
甲基
Nature子刊,|,浙江大學劉琬璐等團隊用甲基轉移酶异比特靶向擬南芥中CG,DNA甲基化
將錶觀遺傳標記靶向特定位點的能力在基礎研究和作物植物工程中都很重要。但是,靶向DNA甲基化的遺傳性,其如何影響基因表達以及正確建立所需的錶觀遺傳特徵尚不清楚。在擬南芥中,DNA甲基化發生在三個序列環境中:CG,CHG和CHH。植物中DNA甲
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甲基
擬南芥
nature
dna甲基化
科普
植物所科研人員揭示RNA甲基化修飾調控草莓果實成熟的作用機制
果實中富含的營養成分是人類膳食結構的重要組成部分,對人體健康不可或缺。果實品質在成熟過程中逐漸形成,受到精確調控。植物激素乙烯在呼吸躍變型果實的成熟調控中發揮關鍵作用,而脫落酸則參與非呼吸躍變型果實成熟調控。已有研究表明,DNA甲基化在呼吸
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草莓
甲基
水果
蕃茄
調控
連發2篇Science,|,美國科學院院士Jacobsen揭示DNA甲基化與基因沉默的新機制
DNA甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關,但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。事實上,該研究發現SILENZIO的保守J域基序是其與HSP70相互作用及其沉默功能所必需的。這些結果揭示了分子伴侶J結構域蛋白在DNA甲基化下游的基因
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甲基
科學
dna甲基化
科普
【Science,】連發兩篇!植物DNA甲基化增强/抑制基因表達的分子機制
DNA甲基化與真核基因和轉座子的轉錄抑制有關,但基因沉默的下游機制在很大程度上是未知的。來自美國加州大學洛杉磯分校StevenE.Jacobsen課題組在2018年和2021年連續發表了兩篇Science文章,揭示了植物DNA甲基化促進/抑
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甲基
基因表達
dna
科學
dna甲基化
科普
Genome,Biology,|,中科院北方資源植物重點實驗室秦國政等揭示m6A甲基化在ABA途徑中的直接作用
錶觀遺傳標記,如DNA甲基化在調節氣候性和非氣候性水果的成熟方面起著關鍵作用。然而,現時還不清楚mRNAm6A甲基化是否在控制不同類型水果的成熟方面具有保守的功能,m6A甲基化已被證明可調節蕃茄的成熟。總之,該研究揭示了m6A甲基化對非成熟
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甲基
水果營養
水果
秦國政
草莓
JCI,湯富酬/喬傑團隊利用DNA甲基化追溯囊胚培養液中游離DNA細胞來源
部分流產胚胎主要是源於胚胎的非整倍體染色體異常,在移植胚胎前鑒定並排除非整倍體胚胎是輔助生殖領域面臨的巨大挑戰。以檢測體外培養胚胎的培養液中游離DNA為代表的無創植入前胚胎遺傳學檢測,因沒有對胚胎本身進行取樣操作,能够避免上述問題,但無創檢
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甲基
dna
追溯系統
dna甲基化
水生所揭示精氨酸甲基化轉移酶Prmt7精准調控抗病毒先天免疫的分子機制
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精氨酸
甲基
科普
調控
Genome,Biology,|揚州大學賀振等揭示了水稻與病毒相互作用過程中m6A修飾的動態變化
N6-甲基腺苷是真核生物中最常見的RNA修飾,已被認為是參與各種生物過程的新型錶觀遺傳標記。m6A在幾個主要人類病毒性疾病的調控中的模式和功能剖析已經被報導。然而,m6A在植物病害爆發中的分佈模式和功能在很大程度上還是未知的。然而,對於m6
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甲基
基因合成
科普
信使rna
科技新聞
川大華西第二醫院王平團隊等揭示人卵細胞錶觀遺傳動態概觀
該研究深入分析了人卵細胞DNA甲基化的從頭建立過程和分子調控特徵,對於理解人類生殖細胞的錶觀遺傳程式設計及其相關機理具有重要意義。
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卵細胞
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錶觀遺傳
王平
科學
科普
Nature子刊,生於憂患、死於安樂,刺激的環境,會讓大腦保持年輕
2000多年前,孟子就曾說過——生於憂患、死於安樂。通過單核苷酸分辯率的全基因組DNA甲基化測序,證明了高刺激環境還能恢復大腦海馬中大量與年齡相關的DNA甲基化變化,表明高刺激環境能够使大腦的記憶控制中心海馬體保持年輕。
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甲基
科學
nature
科普
dna
dna甲基化
分子植物中心蔡偉明研究組揭示空間飛行微重力對擬南芥DNA甲基化水准的影響及其傳代效應
進一步揭示了空間微重力對DNA甲基化影響在子代的遺存並影響子代基因的表達情况,隨著後代繁育次數的新增這種影響會逐漸减弱。
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甲基
擬南芥
分子細胞卓越創新中心鮑嵐組揭示α微管蛋白三甲基化修飾在神經系統發育過程中的作用及其機制
已有研究表明,在α微管蛋白乙醯化修飾的同一位點上還存在著由SETD2催化的三甲基化修飾,但關於α微管蛋白三甲基化修飾對微管功能的調控機制及其在神經系統發育過程中的作用還知之甚少。
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甲基
微管蛋白
組蛋白
神經元細胞
神經系統
科學
遺傳所白洋研究組和曹曉風研究組聯合揭示水稻組蛋白甲基化調控根系覈心菌群
儘管錶觀遺傳調控與宿主微生物組的關係已在動物模型中得到廣泛研究,但在植物中相關研究較少。這些結果表明水稻組蛋白甲基化在調控根系微生物群落的組裝過程中起關鍵作用,為植物錶觀遺傳調控與根系微生物組之間的聯系提供新思路。
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水稻
甲基
微生物
組蛋白
科學
科普
植物所科研人員揭示組蛋白H3K9甲基化修飾調控植物乾旱脅迫響應的新機制
組蛋白H3K9me2修飾主要富集在异染色質區域,促進轉座子及其他重複序列的沉默。有趣的是H3K9me2修飾還富集在基因區域,且乾旱脅迫響應基因的誘導表達與H3K9me2修飾水准降低相關,但H3K9me2修飾調控植物乾旱脅迫響應的分子機理尚不
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植物
甲基
組蛋白
科普
調控
營養與健康所王澤峰研究組發現精氨酸甲基化在RNA剪接和翻譯全域調控中的關鍵作用
該研究系統性地將每個PRMT和精氨酸甲基化事件聯系起來,並提供了PRMT生物學功能的新見解,揭示了精氨酸甲基化在RNA加工和翻譯調控中的關鍵功能。
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甲基
精氨酸
科學
科普
rna剪接
調控
北大生命科學學院伊成器/陶偉與合作者繪製人體組織5-羥甲基胞嘧啶圖譜
腫瘤組織中5hmC的整體含量較正常組織有顯著降低,暗示全基因組範圍內5hmC的失調可能參與調控腫瘤的發生發展。人體細胞中天然存在多種類型的DNA堿基修飾,雖然哺乳動物細胞系和小鼠組織的羥甲基組圖譜早有研究,但迄今為止,人類組織中的5hmC圖
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甲基
胞嘧啶
特异性
大學
生物技術
北大
華大醫學院博士生發表RNA甲基化調控大腦發育的重要成果
“CellDeath&Disease”是Nature旗下具有高影響力和權威性的國際期刊,2021年影響因數為8.469。正常的大腦發育依賴於精確的基因表達調控。然而,最覈心的甲基轉移酶Mettl3和去甲基化酶Fto在哺乳動物大腦發育
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甲基
醫學院
博士生
科學
科普
調控
分子細胞中心周小龍組提出人胞質tRNA3-甲基胞嘧啶修飾酶底物互斥識別模型
在細胞內所有RNA分子中,tRNA含有最為密集且種類最為多樣的轉錄後修。此外,m3C還存在於哺乳動物細胞質延伸tRNAMet第20比特及tRNASer、tRNALeu第47d比特。現時僅鑒定出m3C32甲基轉移酶,m3C20及m3C47d甲
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甲基
科學
胞嘧啶
科普
維他命E的“前世”和“今生”
維他命E作為人和動物體必需且最主要的抗氧化劑之一,功效廣泛,可用作維持機體正常功能,提高機體生育能力、免疫能力等,在醫藥、飼料等領域中佔有重要地位。維他命E是我國的民生基礎產業產品,也是國際市場上用途非常廣泛、產銷量極大的三大維他命支柱產品
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維他命e
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芳樟醇
生物技術
苯酚
Chem,|,中山大學劉建波等人首次通過傳統的醯胺鍵形成策略實現了以羧酸為原料的氮-三氟甲基醯胺的合成
在生物分子、藥物和農用化學品中發現,含醯胺分子在自然界中無處不在,它們的衍生化代表了氟化學中一個重要的方法學目標。三氟甲基醯胺已成為藥物化合物中常見的重要官能團。迄今為止,還沒有從豐富的有機羧酸衍生物合成N-三氟甲基醯胺的策略,這些羧酸衍生
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甲基
萊布尼茨催化研究所M.,Beller院士Chem.,Sci.,通過鈀催化羰基化合成α-三氟甲基-和α-全氟烷基-β-內醯胺的策略
西安工程大學李揚副教授課題組聯合德國萊布尼茨催化研究所MatthiasBeller院士在Chem.Sci上報導了一例鈀催化含氟烯烴羰基化反應構建α-三氟甲基化內醯胺的工作,作者採用廉價易得的2-溴三氟丙烯為三氟甲基試劑源,在一氧化碳存在的條
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β-內醯胺
科學
科普
Nature子刊,|,連續取得進展!北京大學伊成器團隊開發新的科技,揭示了人類轉錄組中的動態m6Am甲基化
N6,2'-O-二甲基腺苷是與mRNA帽相鄰的末端修飾,是一種新發現的可逆RNA修飾。然而,缺乏直接映射全轉錄組m6Am的特定且敏感的工具。m6Am-seq直接區分m6Am和5'-UTRN6-甲基腺苷,並能够以單堿基分辯率識
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甲基
轉錄組
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項宏發教授,EnSM,N,O-雙(三甲基矽基)三氟乙醯胺(BSTFA),一種用於超低濃度鈉金屬電池電解液的多功能添加劑
作為下一代鋰離子電池的熱門候選者,鈉金屬電池的實用化仍然受限於不穩定的電極/電解液介面層和不受控生長的鈉枝晶。該研究論文將乙醯胺添加劑N,O-雙三氟乙醯胺引入到超低濃度電解液中,以優化Na||Na3V23金屬電池在寬溫範圍內的電化學效能。
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電池
電解液
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香港中文大學陳偉儀教授課題組Advanced,Science封面故事,哺乳動物中被遺落的DNA,non-CG甲基化
DNA甲基化是基因表觀遺傳學的重要機制之一,參與調控基因表達和細胞分化。以往哺乳動物中出現的低頻non-CG甲基化被認為是人為造成的,它的作用長期被忽視。已知在小鼠胚胎發育過程中,Pten缺失會引起胚胎致死。陳偉儀教授團隊發現Pten缺失通
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甲基
dna
哺乳綱
科學
科普
dna甲基化
分子植物中心朱健康研究組揭示維持DNA甲基化和基因組穩定的新機制
因而,生物個體是如何維持跳躍基因上面緻密的DNA甲基化修飾一直是錶觀遺傳領域中重要的研究方向。在植物中,多種DNA甲基化調控通路合作維持不同基因組位置的跳躍基因上緻密的DNA甲基化狀態。
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基因組
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朱健康
科學
科普
dna甲基化
鄭州大學農學院在還田秸稈尺度調控稻田汞甲基化及其在稻米中的富集機制研究方面取得進展
文章揭示了通過控制秸稈尺度調控因秸稈還田導致的稻田汞甲基化及稻米汞富集的機制。本研究發現,通過控制秸稈還田時秸稈的大小能够顯著影響到稻田土壤中汞的甲基化過程及成熟稻米中甲基汞的含量。囙此,秸稈還田時對秸稈進行粉碎處理,不失為一種有效且環境友
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秸稈
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農業
三農
調控
《合成生物學》精選文章|甲醇生物轉化的機遇與挑戰
甲醇以其易儲存和易運輸等特性,成為極具應用潜力的原料。甲醇生物轉化有望進一步拓展現有甲醇轉化路線,推動我國煤炭資源潔淨利用以及CO2利用。通過天然/人工甲基營養型代謝途徑相互借鑒,採用代謝工程與合成生物學策略,提高甲醇利用效率、底物與產物耐
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合成生物學
甲醇
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生物轉化
能源
甲基
【Plant,Cell】華中農業大學周道繡課題組揭示植物能量感受器SnRK1通過調節組蛋白去甲基化酶活來響應能量饑餓
在真核生物中,由高度保守的AMPK/SNF1/SnRK1蛋白激酶充當細胞能量感受器。在植物中,SnRK1s充當細胞能量穩態的主要調節劑。長期的黑暗,缺氧或光合作用的化學抑制可導致低養分脅迫或能量饑餓,從而啟動SnRK1活性,外源蔗糖或葡萄糖
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甲基
組蛋白
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華中農大揭示組蛋白去甲基化酶參與水稻能量穩態調節表觀遺傳學機制
能量穩態對於所有生命都至關重要。真核生物含有一類在進化上極其保守的激酶複合體SNF1,其在能量穩態的調節中扮演著覈心調控因數的角色,這類激酶在植物中被稱之為SnRK1。SnRK1一般通過對其他蛋白進行磷酸化修飾來進行能量相關訊號的傳導與調控
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水稻
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組蛋白
表觀遺傳學
科普
Nature子刊,|中國科學技術大學田志剛等m6A甲基化保障了NK細胞的穩態和腫瘤免疫監視功能
自然殺傷細胞在抗腫瘤免疫中發揮著關鍵作用,但它們的功能如何受錶觀轉錄修飾的調節還不清楚。NK細胞的效應功能也受到可溶性分子的調節。對於適應性免疫,已經證明m6A甲基化支持CD4+T細胞的增殖和分化,並控制T調節細胞的免疫抑制功能。衝突的是,
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甲基
腫瘤
腫瘤免疫
細胞免疫
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南開朱守非組,銠催化的偕二芳基卡賓對硼氫鍵不對稱插入,高效合成手性偕二芳基甲基硼
南開大學化學學院朱守非課題組近年來發展了一系列卡賓對硼氫鍵的插入反應,合成了多種結構新穎的有機硼試劑。最近,該課題組報導了偕二芳基卡賓對硼氫鍵的不對稱插入反應,高效、高選擇性地製備了手性偕二芳甲基硼,收率高,對映選擇性好,官能團耐受性優异,
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Nature子刊|復旦大學王陳繼等發現SPOP突變可以單獨DNA甲基化抑制劑或與他汀類化療藥物聯合使用有效治療PCa的生物標誌物
據報導,SPOPE3連接酶基因的突變與前列腺癌的全基因組DNA高甲基化有關,但其基本機制仍然難以捉摸。一些研究小組已經在PCa的原發和轉移階段進行了DNA甲基化分析。值得注意的是,與其他基因亞型相比,SPOP突變的原發性腫瘤與全球DNA高甲
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化療藥物
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上科大食物决定發育命運!生命學院朱煥乎組發現脂肪酸調控營養感知和發育代謝新機制
食物是包括人類在內的所有動物生長發育最重要的資源之一。
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脂肪酸
胺基酸
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東京大學Yohei,Katsuyama組Angew,|,GPP,C-6甲基轉移酶的鑒定並工程化改造創建FPP,C-6甲基轉移酶
异戊二烯焦磷酸甲基轉移酶豐富萜類化合物結構多樣性。本文作者使用多種策略表徵香葉基焦磷酸C-6-甲基轉移酶BezA。生化分析顯示BezA需要Mg2作為輔因數並且僅甲基化GPP。最後作者構建W210A突變體發現其底物偏好為法呢基焦磷酸FPP而非
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甲基
ATVB,|,陸軍軍醫大學文愛清/吳煌揭示RNA甲基轉移酶METTL3調控血栓形成的作用機制
然而,N6-甲基腺苷修飾是否對血栓形成有作用尚不清楚。本研究揭示了METTL3調控纖維蛋白溶解的新機制,為m6A修飾參與調控血栓形成提供了實驗依據,並為血栓性疾病治療藥物的開發提供了潜在新靶點。血栓性疾病,嚴重威脅人類生命健康,成為導致全球
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血栓
甲基
纖維蛋白溶解
纖維蛋白原
內皮細胞
科普
Nucleic,Acids,Res,|上海藥物所羅成課題組開發可高通量化的5mC/m6A修飾酶的酶活檢測方法
調控5mC/m6A水准的修飾酶包括甲基轉移酶DNMTs、METTL3/METTL14及去甲基化酶TETs、FTO、ALKBH5等。囙此,現時5mC和m6A甲基化酶的活性檢測主要通過放射性同位素標記法進行11,12,而5mC和m6A去甲基化酶
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甲基
羅成
科學
doi
科普
中南大學王建新教授團隊在DNA甲基化檢測研究中取得重要進展
DNA甲基化是表觀遺傳學中的一個重要研究問題,其在染色質結構和組織水准上的生物過程中起主要作用。
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甲基
王建新
測序深度
科學
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dna甲基化
南京農業大學資源與環境科學學院趙方傑團隊揭示了水稻土中甲基砷脫甲基的微生物學機制
土壤中砷的化學形態眾多,不同形態砷的生物毒性迥異。稻田淹水條件促進了土壤微生物對砷的還原和甲基化,產生單甲基砷和二甲基砷等形態。而三價的單甲基砷具有抗生素的功效,可抑制一些微生物的生長。與此同時,土壤中的一些微生物可將甲基砷脫甲基,從而構成
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水稻土
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