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測序深度
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華大“超級生命電腦”來了
10月25日,華大集團子公司華大智造發佈了其自主研發的最新超高通量基因測序儀。其一天就可以完成60例個人全基因組測序,6臺機器一年可完成10萬人基因組測序,是現時全球日生產能力最强的基因測序儀,囙此被人稱為“超級生命電腦”。
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測序中國
測序儀
測序深度
外顯子測序
晶片
三代測序科技,讓你“看清”微生物基因“骨架”
但隨著二代測序科技的發展,能够使我們以較高通量的方法去瞭解腸道微生物種。近年來,三代測序科技發展迅速,又彌補了二代測序科技的一些不足,兩者相結合,為探索腸道微生物種提供了較好的方法條件。
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微生物
基因測序
腸道菌群
科學
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王軍
【總結】我國棉花基因組研究連發10篇Nat,Genetics/2篇Nat,Biotech文章,在棉花基因組研究中取得系列進展!
囙此,充分對棉花功能基因組研究,對加快選育優質的棉花品種和我國棉花產業可持續發展具有非常重要的意義。囙此獲得A基因組亞洲棉和D基因組雷蒙德氏棉基因對於獲得四倍體棉花基因組至關重要。
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基因組
棉花
基因組注釋
測序中國
科學
測序深度
北大湯富酬課題組開發出單細胞基因組單分子測序新方法
單細胞全基因組測序科技可以有效揭示生物樣品中不同細胞之間的異質性,並系統鑒定單個細胞的基因組中發生的遺傳變化,例如拷貝數變異和點突變等。結構變異是人類體細胞遺傳變異的主要來源之一,對腫瘤的發生、發展和轉移具有潜在的驅動作用,然而現時在單個細
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基因組
染色體結構變異
人類染色體
測序深度
科學
科普
Nature,Methods(IF=30.8)∣哈佛大學發表單細胞測序(scRNA-seq)的優勢及局限總結
2021-06-21年NatureMethods上發表,單細胞轉錄組測序的優勢及局限總結。作者是美國哈佛大學醫學院PeterV.Kharchenko教授。隨著單細胞轉錄組測序科技的飛速發展,湧現出各種新興的資料分析方法,用於研究例如細胞類型
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聚類
大數據
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nature
科普
中南大學王建新教授團隊在DNA甲基化檢測研究中取得重要進展
DNA甲基化是表觀遺傳學中的一個重要研究問題,其在染色質結構和組織水准上的生物過程中起主要作用。
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甲基
王建新
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科學
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dna甲基化
清華生命學院張强鋒課題組開發RNA結構測序數據缺失訊號恢復的人工智慧方法
RNA結構是RNA發揮功能的基礎。傳統解析RNA結構的方法包括X射線、核磁共振和冷凍電子顯微鏡。近年來,研究者們開發出了許多細胞內高通量探測RNA結構的科技,極大推動了RNA結構和功能的研究。但是這些科技探測到的RNA結構訊號經常包含大量的
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人工智慧
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北京基因組所(國家生物資訊中心)開發基於低測序深度ATAC-seq數據的核小體排布和染色質開放性檢測科技
核小體排布和染色質開放性是重要的表觀遺傳學訊號,與基因表達調控,胚胎發育,組織分化等眾多生理過程間存在緊密聯系。現時,ATAC-seq因其對樣品要求低,處理簡單,可獲得多維度染色質狀態資訊等優勢成為表觀遺傳學的藝員科技之一。囙此,研發能適用
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染色質
基因組
核小體
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Nature,Communications|微生物所王軍研究組結合三代測序合作解析腸道菌群結構變異和功能
近十年來,腸道微生物組已成為生命科學研究領域的熱點,但現時大部分研究都集中在使用二代測序科技進行物種和功能的解析,宏基因組的拼接質量不高並且很難實現菌株水准的功能差异分析。圖2腸道微生物中與SVs相關的功能研究結果。
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微生物
腸道菌群
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王軍
測序中國
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