随着杜兆才被纪委官宣涉嫌严重违纪违法，中国足球的反腐也被推至了高潮，除了主管青训的副主席高洪波、主管商务开发的副主席孙雯以及与杜兆才有千丝万缕联系的纪委书记闫占河，中国足协的高层官员已几乎是全军覆没了。但是，杜兆才之所以被带走的原因还没有被官宣。不过，杜兆才在足协任职期间的“多宗罪”，似乎是可以供参考。
虽然和陈戌源一样，杜兆才也没能逃过恢恢天网。但两人在足协并非同一条绳子上的蚂蚱，而是长时间处在了对立面，形成了双足鼎立的局面。但相比空降的陈戌源，杜兆才的“功力”无疑是高出一筹。在球迷们眼中，陈戌源总是被当成了足协的代言人以及阻碍中国足球进步的绊脚石。殊不知，陈戌源在多数时间里都只是在扮演背锅侠的角色，杜兆才是中国足协真正的混沌之源。中国足协内部的混乱不堪，也和杜陈间的斗争有很大的关系。
而陈戌源之所以在足协人微言轻，甚至在一定程度上被架空，也和杜兆才在足协大范围安插亲信的行为有关。此前被不少媒体人曝出的“杜门九虎”，也正是来源于此。据悉，被杜兆才安插在足协的官员遍布了各大部门，杜兆才的这些亲信几乎都没有足球相关的从业经验，其中还不乏一些颜值颇高的美女。而在足协之外，杜兆才的人际关系也搞得是风生水起，像赞助中国足协的某海参公司老总，据说从杜兆才在大连做大学校长时就已相识。也有网络传闻称，昆山FC投资人有迈体育的美女老总“TTT”，还曾认杜兆才做了干叔叔。
如果说杜兆才上述的做法只是把足协搞了个乌烟瘴气，那么他对曾经那支女足的干涉，则是直接影响了中国足球的成绩。当年，唐佳丽、姚伟、马君、娄佳丽等实力派球员都落选了贾秀全的大名单，导致了在东京奥运会上的惨败。贾秀全虽为女足成绩的第一责任人，但在选人上并不具备全部的话语权。在当时，各地方体育局只要有球员入选，就相当于拿到了一块全运金牌，所以贾秀全的女足已不再像是一支为国征战奥运的队伍，更像是被杜兆才操控的利益分配场。可想而知，这其中必然存在着一定的猫腻。
除了女足，杜兆才最为人怀疑和诟病的，就要数其在担任亚洲杯筹备负责人期间的所作所为了。据悉，由杜兆才领导的亚洲杯45人筹备组在18个月的时间里花掉了惊人的7000万。就算这45个人的月均工资是5万块，18个月下来也不过只有4000余万，剩下的钱究竟去了哪，杜兆才恐怕是最为清楚了。更为夸张的是，各办赛城市当时都向杜兆才的亚洲杯筹备组缴纳了1500万的申办保证金。但当中国无缘了亚洲杯的承办后，很多城市都只拿回了800万。而杜兆才此次之所以被有关部门定性为严重违纪违法，也极有可能与此事有关。
除此之外，也有网络传言，足协当年所收的17亿，有一部分被拿去用在了前国足主帅卡马乔的违约金上，杜兆才充当了背后的决策人，也不是没有可能。此外，前《体坛周报》记者冉雄飞也曾透露，里皮当年在国足担任主教练时，李铁还曾跑到杜兆才的办公室中“拆台”，声称里皮不懂中国足球，中国足球的事情就应该由让中国人来办。此后，李铁也在里皮辞职后顺利的登上了国足主帅的宝座。而冉雄飞也表示，李铁的沈阳8号公园，也是由杜兆才审批的。沈阳8号公园能轻易更改所在位置的土地性质，也和杜兆才的极力护航有关。