对于蒙古地区来说，可分为漠北蒙古和漠南蒙古。两者纳入到清朝的版图，时间也不同。而清朝对蒙古的统治是如何的？他做到了什么程度？从国策上来看，自从康熙平定三藩之乱后，清朝的政策就发生了变化。南不封王，北不断亲。这成为清朝的国策。可见与蒙古的联姻，是清朝一直不变的政策。除了联姻，清朝还对蒙古还有哪些政策？
一：推行盟旗制度。
康熙时期，把外蒙古纳入到版图后。为了管理好外蒙古，清朝采取了盟旗制。盟旗制是清朝对蒙古的统治制度。在承认国家主权以及中央权威性的时候，清廷利用这种制度，瓦解蒙古各国的团结。而盟旗制在当时可以说是非常先进的。即尊重了少数民族的习俗和土地外，也限制了蒙古各部联合起来。盟旗制一开始从漠南蒙古实行，最后推广到外蒙古、青海、新疆的蒙古族中。由理藩院和派驻的地方将军，以及都统进行管辖。漠北蒙古分为四盟，八十六旗。
在推广盟旗制中，对蒙古各部的游牧地界进行划定，以及对人口进行编审，由任命官员进行管理。按照规定，蒙古各部不得随意走动，牧民也不能跨越地界去放牧，如有越界，将会受到惩罚。而对清朝有贡献的部落，清朝将会奖励，使得这些部落可以为清廷效力，最后得到清廷的认可和封赏。在恩赐下，蒙古各部逐渐融入到清朝中。清朝的权威性在蒙古地区进一步加强，蒙古贵族也与清朝彻底捆绑在一起。
二：宗教的推广和限制人口增长。
在蒙古地区中，推广宗教，是清朝对蒙古实行的另一个政策。宗教以藏传佛教为主，其下还有一个黄教。而这个宗教以不近女色为教义，只要出家努力修行，就会获得相当大的好处，不用承担兵役、徭役、赋税、生产等各方面的劳动。如果修成高僧，就能获得清政府的认同和封赏，这让许多人纷纷加入进来，这也是改变一个家庭的好机会。而清廷在蒙古地区修建大量的寺庙，也是为了推广宗教。
而这个结果是，大量的男性蒙古族选择出家，为了改变命运，为了获得清廷的册封，他们都选择出家。这也限制了外蒙古的人口增长，甚至下降，出生率极低。在“崇释以制其生”的政策下，清朝不仅解决了蒙古地区的叛乱问题，还能让蒙古族为清廷效力。而推广藏传佛教，表明上是为了让蒙古族信仰自由，实际是清朝用来控制蒙古族的手段。
三：清朝在外蒙古的驻防。
清朝在外蒙古设置乌里雅苏台将军，用于管辖整个漠北蒙古。而在外蒙古驻军，是在康熙时间。为了防止准噶尔东征，1719年，康熙决定在外蒙古驻军。为了进一步加强漠北蒙古的安全。清朝在鄂龙吉和噶顺等地驻军，各有一千兵驻守，他们是清朝抵抗准噶尔的前沿阵地。雍正时期，在阿尔泰山、乌兰古木、察罕叟尔、扎克拜达里克等地均有驻军，满洲兵有两千，四年一换，蒙古兵有两千名永远驻守。1733年，清准进入和平时期，清军也移入乌里雅苏台驻防。
平定准噶尔后，清朝在外蒙古的驻军，主要是在乌里雅苏台、科布多等地，其他地方的驻防，根据需要做调控。清军驻防乌里雅苏台，三年一换，数量不多。驻防官兵饷银由绥远城发放。而科布多的驻防，以绿营兵为主。科布多的驻防，由绥远城负责调遣和换防。配上卡伦兵的巡逻，清朝的边疆地区，才得以有效的控制。
从这些可以看出，清朝对外蒙古的控制，甚至整个蒙古地区，都是有针对性的。特别是在推广宗教这方面，他让蒙古族人口倒退。而面对这种情况，外蒙古还愿意接受清朝的统治，主要还是蒙古的王公贵族得到了好处，他们接受了清朝恩赐，享受荣华富贵。
而底层平民只能通过出家，或者投身军营，慢慢的往上爬，但想要上升到贵族，没那么容易。虽然清廷的手段有些残忍，但无疑是解决蒙古问题的好方法。这也是多年以来，中原王朝无法解决的蒙古问题，在清朝得以解决。可见清廷的手段之高。