蒋经国和宋美龄一直不和，如果推究原因其实还是蒋介石导致的，我们都知道，蒋介石一辈子就一个亲生儿子，是他与自己的原配毛福梅所生，这个儿子就是蒋经国，蒋介石那个时候有个三妻四妾很正常，所以蒋介石后来就又找了两个妾室，但一直没有和毛福梅离婚，毛福梅仍然是妻。
蒋介石在政权基本稳定后，就将蒋经国送到苏联学习，蒋经国仍然保持着与母亲毛福梅的联络，经常写信回家，蒋介石为了能够得到孔宋两家的支持，就对宋家的三小姐宋美龄展开追求，宋美龄提出的第一个要求就是嫁给蒋介石可以，但是必须她做大的，休掉毛福梅。
蒋介石当时迫切需要孔宋两家帮他维持地位，丝毫没有犹豫，将毛福梅休掉了，宋美龄也就顺理成章的嫁给了蒋介石，但蒋经国却不乐意了，自己的母亲被父亲休掉，一切都是因为宋美龄，而毛福梅后来在日军的一次轰炸中丧生，蒋经国将此事归咎给了宋美龄，两人从此反目成仇。
毛福梅死后，蒋经国从苏联赶回，并没有与宋美龄兵戎相见，但也没怎么搭理宋美龄，蒋介石虽然多次调解，但仍然无法缓和两个人的关系，蒋经国眼不见心不烦，直接跟蒋介石要了个官位，跑去当官了，蒋介石看到蒋经国这个态度后，也只能同意了下来，后来战事繁忙，蒋介石也就不再谈论此事。
1949年，蒋介石兵败逃到了台湾，蒋介石虽然心中不舍，但是却有了难得的闲暇时光，终于可以去做一些自己喜欢的事情，宋美龄和蒋经国当然也跟蒋介石回到了台湾，两人同住总统府，低头不见抬头见，有时还要在同一个饭桌上吃饭，蒋介石也赶到别扭，于是再次与蒋经国谈话。
蒋经国也是个孝子，知道蒋介石当时的身体不是很好，也不想在气蒋介石，所以对宋美龄的态度开始好转，经常跟着蒋介石与宋美龄一同出游，或者参加一些宴会，宋美龄以为蒋经国想开了，所以对蒋经国也没有了那么仇视，两人的关系看起来就像是母子一样。
1975年，蒋介石去世，蒋经国掌权，蒋介石的追悼会结束后，蒋经国拿出了蒋介石的日记本，丢给了宋美龄让她自己看，其中有这么一句：我死后，你们要好好侍奉宋美龄，她是你们永远的母亲。宋美龄明白了蒋经国的意思，我并不是与你和好，只是是父亲的意思，现在他死了，你知道自己该怎么做了吧。宋美龄在蒋介石的追悼会结束后，连夜前往了美国，从此很少再回来。