国庆将近,很多人都准备来一场说走就走的旅行,但新型冠状病毒却给大家的出行蒙上了一层淡淡的「阴翳」。近日来,上海、福建、黑龙江、浙江等地均报告多例境外输入型新冠肺炎确诊病例......
识别感染的「幕后真凶」,确定病原体的真实身份,是有效疫情防控措施的第一步,这有赖于现代检测技术的速度和准确度。
说起来,宏基因组二代测序技术对抗击新冠「功不可没」,因为新冠病毒的真面目——基因序列,最早就是中国科学家利用它揭开的。
日前,在《中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识》线上解读研讨会上,复旦大学附属华山医院感染科张文宏教授对宏基因组学第二代测序技术做了解读。
给新冠病毒测序的技术究竟是啥?
简单来说,宏基因组二代测序(metagenomics next generation sequencing,mNGS)是一种新型的病原体检测技术。
它直接对检测样本中的遗传物质即核酸,进行高通量测序,然后把得到的核酸序列,与库里的各个物种(病毒、细菌、真菌、寄生虫)的基因组序列进行对比,就能知道检测样本中微生物的种类和比例。
相比于传统的微生物培养,mNGS速度大大加快,因此尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。
出现全新未知病原体怎么办?
作为感染科专家,张文宏教授表示,「宏基因组二代测序结果就像是一篇影像报告,但最终的诊断,还需要临床医生根据现实中复杂的情况和众多的信息,做出综合判断。
就像这次新冠病毒的序列,最早是基于宏基因组二代测序的技术发现的,但是它最早给出的结果并不是COVID-19,而是有可能是SARS。在这个基础上,进一步精准测序后,才知道它是一个新的物种。
很多新的物种如果之前不存在与基因库中,可能二代测序进去后什么东西都找不到,但是这个时候如果用培养的方法,包括病毒培养和细菌培养,都有可能会发现一个新的物种。
宏基因组二代测序技术的问世,不仅仅是检验、重症、感染性疾病,呼吸等众多领域共同的财富,应该会对整个领域,或在诊断其他的疾病方面,都带来重大的一个改变,希望未来我们能用好这个技术。」
会议中,多位专家就此发表了自己的见解。大家一致认为,作为一个新的临床诊断帮手,宏基因组二代测序技术帮助临床打开了微生物认知的一扇门,在应用中需要以患者为中心。
宏基因组二代测序技术应用的范围、样本采集、分析解读和诊断效能等方面都需要进行规范,才能发挥最大的价值。在经济允许的前提下,提倡宏基因组二代测序与当前传统检测同时送检,综合分析,才能得到真实、客观的结论。
同时,一项新型技术需要不断进行完善,临床检验科室要逐步进行本地化应用。
综上,宏基因组二代测序技术可以说是一种「利器」,但在与病原体的永恒战争中,人类还要加以人类智慧,用好手中的武器,才能消灭敌人,维护生命健康。
本次《中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识》线上解读研讨会,由MED24提供全程技术支持。
最后,希望大家在国庆期间做好防护,出行前可扫描下方小程序码,查询各地疫情防控政策!
编辑 | 书怡 格格巫
视频 | 孙振