研究人員更精確地解析RNA的複雜結構。圖片來源:視覺中國
科技日報北京4月29日電(記者張夢然)由新加坡科技研究局基因組研究所領導的科學家團隊,發佈了迄今全球最大、最全面的長讀長RNA測序數据集之一——新加坡納米孔表達數据集(SG-NEx)。這一成果有望解決疾病研究中長期存在的科技瓶頸,使研究人員能够更精確地解析RNA的複雜結構,為製定下一代精准診斷和治療策略奠定了堅實基礎。相關研究發表在最新一期《自然·方法學》期刊上。
短讀長RNA測序是現代轉錄組學的覈心工具,但其局限性日益顯現。它通常無法完整捕獲全長RNA分子以及諸如剪接異構體、融合轉錄本等複雜變異,也無法識別影響疾病進展(如癌症)的關鍵RNA化學修飾。這些缺陷限制了其在發現臨床相關生物標誌物方面的應用潜力。
相比之下,SG-NEx採用的是長讀長RNA測序科技,能够直接讀取完整的RNA分子,從而揭示更深層次的生物學資訊,並顯著减少分析盲區。這種能力對於發現新的生物標誌物和開發更精確的治療方法至關重要。
為了形象理解,可以將RNA比作一本書:短讀長測序就像將書頁撕成碎片後嘗試重建內容,容易遺漏細節且容易出錯;而長讀長測序則像是閱讀整頁甚至整章,使關鍵資訊特別是那些隱藏在與疾病相關的複雜RNA結構中的細節得以清晰呈現。
為最大化該數据集的影響力,SG-NEx項目採取快速公開發佈數據策略,允許世界各地的研究者基於這些高品質數據開發並驗證新的RNA分析方法。這被認為是推動生物醫學發現、釋放長讀長測序潜力、改善疾病診斷和患者護理的重要一步。
現時,團隊正進一步推進項目發展,計畫開發用於自動化RNA特徵識別的人工智慧工具、擴大全球資料共用範圍,並推動長讀長測序方案的標準化。這些舉措將為長讀長RNA測序科技在臨床中的廣泛應用提供重要支撐。
【總編輯圈點】
傳統短讀測序像“拼碎片”,容易遺漏關鍵資訊;長讀測序能直接“讀整頁書”,完整揭示關鍵資訊。此次,新加坡科研團隊發佈了全球最大、最全面的長讀長RNA測序數据集——SG-NEx,解决了傳統短讀測序科技難以捕捉複雜RNA結構的問題。SG-NEx還採取快速公開發佈數據策略,全球研究者可利用其開發診斷工具。團隊下一步計畫推動長讀測序的標準化,為精准醫療和下一代RNA科技發展奠定基礎。