蛇毒對各種酶系統的抑制作用早已被人們發現，例如Braganca等1953年就發現腦中的丙酮酸脫氫酶、腦和心臟組織中的琥珀酸脫氫酶、腦組織的細胞色素氧化酶及肝的膽鹼氧化酶都可被蛇毒抑制。當然，所有這些抑制作用並非都由於蛇毒中存在特异抑制劑，有些是由於非特异的蛋白水解酶引起的。近些年，真正的蛇毒酶抑制劑才被分離出來並研究了它們的抑制管道。
一丶PLA2抑制劑
Braganca等1970從眼鏡蛇毒中分離出專一的PLA2抑制劑，分子量為5000，等電點為8.6。Vidal等（1970）發現矛頭蝮類蛇毒中亦有PLA2抑制劑，這就說明為什麼許多矛頭蝮屬蛇毒的PLA2活性比別的蛇毒低。抑制作用在胰蛋白酶作用後就消失，說明抑制劑是一種多肽，經測定等電點為6.8。酶和抑制劑形成的複合物可以經過pH4.5的層析柱分開。Hg2+可使抑制劑失活，但Hg2+對PLA2無影響，囙此當Hg++加到抑制劑與PLA2混合物中，PLA2活力明顯增强。抑制劑的存在是PLA2作用出現“延遲期”的原因。Kihara（1976）發現黃綠烙鐵頭的血清中也有PLA2抑制劑。
二、乙醯膽鹼酯酶抑制劑
華南眼鏡蛇毒的乙醯膽鹼酯酶活性比銀環蛇毒低得多，推測它的酯酶活性是與專一的抑制劑結合。乙醯膽鹼酯酶被抑制劑滅活是不可逆的。抑制劑作用的最適pH是6.0〜8.5，如pH在5以下或10以上就會失活。
三、血管緊張素轉換酶抑制劑
Oudetti等（1971）發現美洲矛頭蝮蛇毒中含有一種血管緊張素轉換酶抑制劑，它使血管緊張素I不能轉變成血管緊張素I，導致中樞加壓活性失靈。Bakhle等（1972）發現抑制劑濃度在範圍內都可滅活血管緊張素轉換酶。
四、蛋白酶抑制劑
有些蛇毒含有蛋白酶抑制劑，這些抑制劑能使胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶、激肽釋放酶和纖維蛋白溶酶失活。這種抑制劑曾見於唾蛇、白唇曼巴、黑曼巴、金黃眼鏡蛇、埃及眼鏡蛇及圓斑蝰蛇毒中。圓斑蝰蛇毒中的抑制劑I含有47個〜51個胺基酸殘基，抑制劑n含有60個胺基酸殘基。從唾蛇毒分離得到的抑制劑有57個胺基酸殘基。有趣的是蛇毒中蛋白酶抑制劑不能抑制蛇毒蛋白酶的活性，而只能抑制其他動物體內的蛋白酶，如胰蛋白酶，而其他動物血清或分泌物中卻含有抑制蛇毒蛋白酶活性的蛋白酶抑制劑。人血漿就含有大量類似的蛋白酶抑制劑，這些抑制劑在正常情况下調節血液中蛋白酶的活性，並抑制進入體內的外源蛋白酶。Lawrence等（1981）發現人血裝a2-球蛋白可以抑制幾種響尾蛇毒中蛋白酶的活性，經球蛋白作用後，這些蛋白酶對合成底物沒有水解作用，但東部菱斑響尾蛇蛇毒蛋白水解酶活性只能被部分抑制，作用後仍保留原來53%的活性。其中高分子量的蛋白酶不受a2-球蛋白的影響，這可能是蛇毒保留有蛋白酶活性的原因所在。噝蝰蛇毒蛋白酶活性可被《2-球蛋白徹底抑制，如將其與球蛋白3起溫育3min，有48%的酶活存在；如一起溫育4h，則只有20%的酶活存在。研究表明，a2-球蛋白的抑制作用與它能與蛋白酶形成複合物有關（Starkey等，1977）。一般地說，以複合物形式存在的蛋白酶對天然大分子底物的水解作用消失，但仍能作用於小分子的合成底物。由於血漿中球蛋白的存在，使蛇毒蛋白進入體內後其蛋白酶活性很快失活。但蛇毒進入體內後的作用是複雜的，Kress和Par（1978）的研究表明，雖然球蛋白能抑制蛇毒蛋白酶活性，但蛇毒中的某些蛋白酶也可以通過水解等作用使A-球蛋白等失活。
不管蛇毒中的蛋白酶抑制劑還是其他動物體中的蛋白酶抑制劑，其結構都有一些相似之處.1975年曾比較了下列幾種蛋白質水解酶抑制劑的胺基酸順序：牛胰臟蛋白酶抑制劑、牛乳中的蛋白酶抑制劑、海龜蛋白酶抑制劑、蝸牛蛋白酶抑制劑K、圓斑蝰蛇毒中的蛋白酶抑制劑n、黑曼巴蛇毒中的蛋白酶抑制劑K和I。他們發現這些抑制劑之間極為相似，而且分子內二硫鍵的相對位置都相同。