蛇的育種方法有本品種選育，而常用的方法有近交育種、遠交育種和品系育種三種方法。
（一）近交育種
近交育種是將親緣關係較近的蛇放在一起交配繁殖和選育的方法。主要目的是在生產過程中發現生產性能優良的蛇，然後將其作為種蛇不斷擴大繁殖其後代數量和基因比例。這種方法的優點是能够使一些優良性狀固定，使有害不易表現的性狀顯露出來。缺點是長期近交育種易出現種質退化。
（二）遠交育種
遠交育種即是從氣候條件相差不是很大的外地引人或是野外捕捉較優良的蛇作為種蛇，如廣西可以從湖南、雲南、廣東引人同品種的種蛇與本地種蛇進行交配、繁殖和選留的一種方法。主要目的是改良原有蛇群，提髙蛇群的生長速度、生產效能及抗病能力。此方法的優點是蛇群中很少出現生產效能及生活力極端不良的個體。缺點是蛇群體後代中出現的極優秀個體較少。
（三）品系育種
品系育種即是同時建立具有不同優點的幾個系祖，繁殖後再將幾個系祖結合起來進行交配繁殖的一種方法。如將抗病强、生長生育快的建立一個品系，然後將體質好、體型大、產毒量大的建立一個品系，再挑選兩個品系中優良的種蛇進行交配繁殖，就可以繁殖出生產效能高且抗病能力强、生長速度快的蛇進行商品生產。
三、種蛇規模的確定
養殖場經營的方向不同其育種的規模也不同。如有的養殖場主要焉擴大繁育良種，以供應一般繁殖詞養場和專業戶的合格種蛇為主；有的則是養殖用於出售或是屠宰的成蛇；有的則以采毒為經營目的；有的主要以出售幼蛇為經營目的。囙此，確定蛇群的數量和大小與養殖場的生產規模有著直接的關係，應根據生產輝模來確定種蛇群的規模。如養殖場以飼養灰鼠蛇出售成蛇為主，蛇場計畫年銷售成蛇在10000.條，一般情况下，雌雄蛇的交配比例為5:1，而灰鼠蛇的產卵量為5〜15枚，若孵化率為80%，可孵出10條幼蛇，以8條來計算，則需雌蛇1000多條，雄蛇200多條。囙此，年銷售10000條灰鼠蛇的養殖蛇場，則需具有200多條種雄蛇和1W0多條種雌蛇才能滿足生產需要。