常見的鼻腔疾病包括：
鼻炎是一種鼻腔黏膜（內襯）的炎症。它可以由感染性病原體（細菌、病毒、真菌病原體、寄生蟲）或非感染性疾病引起，包括：异物、過敏、創傷、牙科疾病和環境刺激物。打噴嚏和流鼻涕是很常見的。鼻炎可累及面部鄰近的鼻竇，從而導致鼻竇炎。
腫瘤可能發生在鼻子內。鼻腫瘤大多為惡性腫瘤，如：腺癌、骨肉瘤、淋巴肉瘤和鱗狀細胞癌。腫瘤最初可能發生在鼻子的一側，但隨著時間的推移可能會影響兩側的鼻腔通道。除了打噴嚏和流鼻涕的症狀，寵物臉部或眼睛周圍也可能出現腫脹等現象。
咽部疾病常表現為抽搐、嘔吐或幹嘔。罕見的情况是，猫可能在病變區域發展成炎症性息肉。息肉通常是良性軟組織生長，生長於鼻腔、咽或耳咽管的背面。它們可能會阻礙空氣通過鼻咽部，並引起中耳問題。
喉部疾病經常會引起呼吸窘迫或喘鳴（一種可聽到的高音呼哧呼哧聲）。它們可能只累及喉部或上呼吸道的其他部分。
喉炎是喉部的炎症。它最常見於氣管炎和上呼吸道感染。臨床症狀包括咳嗽、流鼻涕、呼吸困難或嘈雜以及嗓音改變。
短頭綜合征是一種短頭犬的狀況，其中幾個上呼吸道异常同時發生，嚴重减少了空氣的通道。患有這種綜合征的狗可能有先天性小鼻孔（狹窄的鼻腔）、過長的軟齶下垂到鼻咽部、氣管發育不全（氣管發育不全）、聲帶到喉部的疝出（喉小囊外翻）和喉麻痹。所有這些情况都使狗容易出現呼吸困難，特別是當它們變得興奮或過度活躍、局限在小區域、肥胖或暴露在炎熱和潮濕的環境中時。臨床症狀從輕度（呼吸嘈雜、打鼾、嘔吐或痰幹、運動不耐受）到重度（呼吸窘迫、發紺、體溫過高、虛脫、休克）。
喉麻痹是一種獲得性疾病。通常控制喉嚨打開和關閉的軟骨變得癱瘓，喉嚨不能很好地打開。患寵常表現出聲音變化（嘶啞、粗糙的叫聲）、嘈雜的呼吸和運動不耐受。它們也可能在呼吸窘迫時過熱和虛脫。
息肉和腫瘤也可能發生在喉部。
氣管疾病通常與咳嗽、呼吸窘迫、運動不耐受、虛弱、紫紺或暈厥有關。常見的氣管疾病包括以下幾種：
1.傳染性氣管支氣管炎是一種傳染性上呼吸道疾病，常見於與其他受感染猫接觸過的猫，如在寄宿設施或猫展裏的猫。該病通常由病毒（如副流感病毒、腺病毒）和細菌（特別是博氏杆菌）混合引起。與這個疾病有關的咳嗽通常很刺耳，有時會出現咳嗽痙攣的情况，聽起來可能像窒息一般。咳嗽結束時，患寵會嘔吐或幹嘔。氣管通常非常敏感，頸部的任何輕微操作都會導致咳嗽痙攣。
2.當暴露於煙霧、化學物質、灰塵或异物等刺激物時，也可能發生氣管炎或氣管炎症。某些寄生蟲也可能遷移到氣管，引起氣道內的炎症。在全身麻醉中使用氣管插管後偶爾會發生氣管炎。
3.氣管的阻塞可能是由於吸入异物、氣管腫瘤的生長或周圍組織的腫瘤或腫塊撞擊氣管造成的。
4.氣管衰竭是一種常見於中老年猫的疾病。這些猫的氣管c軟骨頂部的軟膜變弱並伸展。這使得c-軟骨塌陷，使空氣難以進入肺部。它可能發生在興奮、運動、頸圈和皮帶對脖子的壓迫，以及寵物進食或飲水時。咳嗽痙攣、呼吸窘迫、虛弱和昏厥有時也會出現在這種情況下。
5.狗的支氣管樹最常見的疾病是支氣管炎。支氣管炎是下呼吸道的炎症，可由感染（如細菌、病毒、支原體、寄生蟲）、刺激物（如煙霧、灰塵、异物）、過敏、肺部疾病等引起。最常見的症狀通常是咳嗽。支氣管炎可以是急性的，也可以是慢性的。