導致獺兔腹瀉的原因有很多，有病源微生物因素，如細菌、寄生蟲等，也有非病源微生因素，如日糧纖維不適，管理和應激、抗生素影響等。其實近年開發了不少兔子疫苗及一些特效藥物，導致兔子腹瀉的病源微生物因素已經得到了很大的控制，但是兔子腹瀉病症仍然頻繁發生，主要原因還會忽視了一些非病源微生物因素，而導致獺兔腹瀉的非病源微生物因素有：
1、日糧纖維性腹瀉：主要是指獺兔的日料中含有的纖維量過高或過低而導致的腹瀉。對生長獺兔進行飼喂實驗的結果顯示：兔子日料中的纖維含量小於9%可引發兔子黏液性腸炎，兔子日料中纖維含量為12% ~ 14%一般不會導致兔子發生腸炎或腹瀉。但就兔子的生長發育情况和飼料利用情况而言，日料中的纖維含量為12%最合適生長期兔子。
2、管理及應激性腹瀉：譟音、仔兔斷奶、生活環境出現較大變動、飼喂時間和飼料的突然變動、長途運輸、驚嚇、冷、熱應激等因素都可以導致兔子發生不同生理階段的腸炎或腹瀉疾病。
3、抗生素相關性腹瀉：不合理使用抗生素及濫用抗生素，可以破壞消化道有益微生物的平衡，進而造成腹瀉病的發生，比如寵主給兔子使用慶大黴素、氨苄青黴素、土黴素等藥物不合理等。
4、中毒性腹瀉：主要指有某些毒素進入兔子機體內而引起兔子腹瀉，其中主要有細菌性毒素（大腸桿菌毒素…）、真菌性毒素（飼料腐敗黴變…）、植物性毒素（牽牛花…）、農藥等毒素。
老資料網溫馨提示：
為了有效减少獺兔發生腹瀉的可能性，提高兔子的生產效率及促進兔業的健康發展，除了需要有效控制病源因素之外，也要重視預防非病源因素。