1.微波食品會產生新的有毒甚至致癌的化合物
微波爐的作用遠不止把物體加熱那麼簡單。食物的分子吸收大量的能量，足以分解蛋白質的分子結構，導致通常情况下不會發生的分子異變。結果，許多新的奇怪的分子出現了。問題就在這裡。食物的分子結構發生了改變，產生了人體不能識別的分子。這些奇怪的新分子是人體不能接受的，有些具有毒性，還可能致癌。囙此，經常吃微波食品的人或動物，體內會發生嚴重的生理變化。
蘇聯人發現，無論何種食物，一旦經過微波加熱，都會產生已知的致癌物。肉類、奶類、穀物、水果和蔬菜都會產生引起癌症的化學物。除此以外，研究人員還發現，吃微波食品的人的消化系統紊亂，淋巴系統發生障礙，血液中的癌細胞新增。統計資料表明，經常吃微波食品的人更容易患胃腸癌，消化系統也會逐漸崩潰。
2.食物的營養價值嚴重流失
蘇聯人還發現，所有實驗中的食物的營養價值都降低了。微波食品的營養價值减少了60%至90%，包括礦物質和生化酶，維他命B、C和E，以及抗脂肪膽物質，甚至連蛋白質的營養成分也减少了。
3.情緒波動、記憶力下降
長期食用微波食品會導致永久性的腦損傷，造成記憶力下降，注意力無法集中，情緒波動，智力下降。
因而使用微波爐需要多注意一些事項：
1.準備的飯菜七成熟
為了防止維他命的反復損失，帶飯時最好只把菜做到七成熟。可以在菜炒到七成熟的時候，把要帶的先盛出來，剩下的做熟了再吃。除了豆角等可能導致中毒的蔬菜，這樣做能更多保留蔬菜的維他命，口感也更鮮美。葷菜中的紅燒雞、炒肉片等做成七成熟，吃前再熱一下，口感會更好。
2.要使用注有微波爐適用的器皿
一定要選擇適合微波爐加熱的飯盒，這樣的飯盒會注明“微波爐適用”的字樣。塑膠沒注明比較差的飯盒加熱容易把物質溶入飯菜裏，有些塑膠在受熱的時候可能會釋放出一些有害的成分來，污染食物，危害人體健康。更不要用金屬器皿，因為放入爐內的鐵、鋁、不銹鋼、搪瓷等器皿，微波爐在加熱時會與之產生電火花並反射微波，既損傷爐體又不能加熱食物。
3.加蓋加熱
加熱時，為了防止水分過度蒸發，應該蓋上蓋子加熱。一般情况下，微波爐加熱便当時間控制在兩分鐘左右。如果飯菜沒熱透，放入微波爐後再稍稍轉兩圈即可。倘若沒碗蓋可用保鮮膜包裹，纏住代替。也可以在飯菜表面少量灑點水。
4.加熱時間不要太長
加熱時間不宜過長。食品放入微波爐解凍或加熱，若忘記取出，如果時間超過2小時，則應丟掉不要，以免引起食物中毒。
5.食物不要放太久
一般準備的食物時間不要放太久，最好在8小時內，早上起來做飯，食物就不容易變質跟有細菌，如果沒時間也可以放在冰柜儲存。
6.液體加熱要放湯匙
如果你要熱湯，最好在容器中放置非金屬的攪拌棒或湯匙，除非你想看熱水噴濺秀。