但值得注意的是，薯類尤其是洋芋，含有一種叫生物鹼為有毒物質，人體攝入大量的生物鹼，會引起中毒、噁心、腹瀉等反應。這種有毒的化合物，通常多集中在洋芋皮裡，囙此食用時一定要去皮，特別是要削淨已變綠的皮。此外，發了芽的洋芋更有毒，食用時一定要把芽和芽根挖掉，並放入清水中浸泡，燉煮時宜大火。
另外，如果孕婦經常食用生物鹼含量較高的薯類，蓄積在體內就可能導致胎兒畸形。當然，人的個體差異相當大，並非每個人食用了薯類都會發生异常，但是孕婦還是以不吃或少吃薯類為好，特別是不吃長期貯存、發芽的薯類，這一點對處於妊娠早期的婦女來說尤其重要。
洋芋不能和什麼一起吃
洋芋與香蕉相克：同食面部會生斑。
洋芋與蕃茄相克：同食會導致消化不良。
食用時一定要去皮，特別是要削淨已變綠的皮。洋芋去皮以後，如果一時不用，可以放入冷水中，再向水中滴幾滴醋，可以使洋芋潔白。
洋芋與雀肉相克：
雀肉：中醫認為，雀肉味甘，性溫，無毒，有補腎、養心氣之功效。主治崩漏帶下；現代醫學研究認為，雀肉含有多種人體必需的胺基酸和大量優質的蛋白質，能增强機體免疫能力。
洋芋：中醫認為，洋芋味甘、辛，性寒，有小毒。有補益腸胃、解毒、止餓之功效；現代醫學研究認為，洋芋是高蛋白、低脂肪、低熱量的健康食品，是肥胖症患者、心腦血管病患者、糖尿病患者的理想食品。