1、細菌菌落是指細菌在固體培養基上繁殖所形成的肉眼可見的菌塊。如果接種菌的密度十分稀薄，且規定一定的培養條件，由於菌的種類不同，它所形成的菌落的形狀、大小、高低、位置、表面的粗細、邊緣的形狀、色調、透明度，以及菌塊的質地、軟硬、粘稠度和特殊培養基的著色等，也各不相同。
2、菌落特徵决定於組成菌落的細胞結構與生長行為，如細菌的莢膜，它的存在與否和菌落形態等有直接關係。肺炎鏈球菌因具有莢膜就形成光滑型菌落，其表面光滑黏稠，不具莢膜的菌株形成的菌落為粗糙型，菌落表面乾燥、有皺折，表明菌落特徵和細菌細胞的結構密切相關。
3、菌落的形狀和大小不僅决定於菌落中細胞的特性，而且也受到周圍菌落的影響，菌落靠得太近，由於營養物質有限，有害代謝物的分泌和積累，因而生長受到抑制。所以在平板分離菌種時，常可看到平板上互相靠近的菌落都較小，而那些分散開的菌落均較大，即使在同一菌落中，由於各個細菌細胞所處的空間位置不同，在營養物的攝取及空氣供應等方面亦都不一樣，所以在生理上、形態上亦或多或少會有所差异。
4、在平板培養基上形成的菌落往往有三種情况，即表面菌落、深層菌落和底層菌落，上面所介紹的菌落特徵都是指表面菌落。某些細菌在明膠培養基中生長繁殖時，能產生明膠酶水解明膠。如果將這些菌種穿刺接種在盛有明膠培養基的試管中，則由於明膠被水解形成不同形狀的溶解區，由於一定的細菌形成一定形狀的溶解區，所以是細菌分類的項目之一。