近期,南京師範大學生命科學學院馬飛教授、金萍副教授團隊與東部戰區總醫院夏欣一教授團隊聯合揭示了ZNF蛋白抗SARS-CoV-2感染機制,該研究成果以《Analyzing master regulators and scRNA-seq of COVID-19 patients reveals an underlying anti-SARS-CoV-2 mechanism of ZNF proteins》為題正式發表在生物資訊學權威期刊Briefings in Bioinformatics,2021,22(5):1~14,https://doi.org/10.1093/bib/bbab118(影響因數:11.622)。南京師範大學生科院博士生秦士傑為第一作者,金萍副教授、馬飛教授和東部戰區總醫院夏欣一教授為論文的通訊作者,第一作者單位為南京師範大學。
新冠病毒大流行以來已經感染超過2億人,造成超400萬人死亡,但是宿主抗SARS-CoV-2侵染機制仍不是十分清楚。馬飛教授、金萍副教授團隊和夏欣一教授團隊從性別差异出發,揭示了臨床上女性COVID-19患者的死亡率和重症率顯著低於男性;並通過系統生物學研究證明了宿主響應SARS-CoV-2感染的主要調節子(eg.STAT1/STAT2和ZNF家族蛋白)在女性和男性之間存在顯著差异,女性COVID-19患者能够比男性患者表達出更多的ZNF蛋白以及更强的活性。ZNF蛋白活性與患者的病毒載量和疾病嚴重程度負相關,而與患者的免疫活性呈正相關。該研究研究首次揭示ZNF不僅可以作為效應蛋白直接抑制SARS-CoV-2,還可作為轉錄因數直接啟動干擾素刺激基因以及促進免疫細胞成熟和活化來抵抗SARS-CoV-2,並提出ZNF蛋白的數量和活性的差异是不同性別COVID-19患者預後不同的潜在原因。
Fig: The model shows that ZNF proteins of COVID-19 patients of different genders resist SARS-CoV-2 infection through TF activity and antiviral activity.
新冠病毒在中國發生的初期,馬飛教授聯合南京師範大學生科院陳禮明教授和南京郵電大學季星來教授揭示了SARS-CoV-2與導致重症的SARS-CoV和MERS-CoV更為相似,發現導致重症的冠狀病毒(SARS-CoV,MERS-CoV,SARS-CoV-2)共亯多個宿主響應基因並且都表現出中性粒細胞的過度活化。東部戰區總醫院夏欣一教授提供的臨床數據進一步驗證了中性粒細胞的過度活化可作為重症COVID-19患者的預後名額。該研究成果以《Mechanistic insights into SARS-CoV-2 epidemic via revealing the features of SARS-CoV-2 coding proteins and host responses upon its infection》為題正式發表在生物資訊學權威期刊Bioinformatics,2021,36(21):5133-5138.https:// doi: 10.1093/bioinformatics/btaa725(影響因數:6.931)。南京師範大學生科院博士生秦士傑和東部戰區總醫院夏欣一教授為共同第一作者,季星來教授、馬飛教授和陳禮明教授為論文的通訊作者,第一作者單位為南京師範大學。
此外,金萍副教授、馬飛教授團隊和夏欣一教授團隊還系統比較了不同嚴重程度的COVID-19患者的各項臨床名額,並且通過隨機森林算灋篩選並建立了可靠的臨床模型(準確性接近90%)用於COVID-19患者的預後監測。該研究成果以《3044 Cases reveal important prognosis signatures of COVID-19 patients》為題正式發表在國際權威期刊Computational and Structural Biotechnology Journal,2021,19:1163-1175.doi: 10.1016/j.csbj.2021.01.042(影響因數:7.272)。南京師範大學生命科學學院博士生秦士傑是該論文的第一作者,金萍副教授、馬飛教授和夏欣一為該論文的通訊作者。該論文的第二通訊組織為南京師範大學。
新冠病毒延續至今,人們對SARS-CoV-2的致病機制和治療仍然需要深入研究。金萍副教授、馬飛教授團隊和夏欣一教授團隊所做的工作不僅新增了我們對COVID-19發病機制和宿主免疫響應的認識,也為臨床上對COVID-19患者的診斷和預後提供了重要的靶標分子。
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