隨著細胞重程式設計、基因編輯、合成生物學、高通量測序等科技的快速發展，再生生物學進入前所未有的蓬勃發展時期，助力解决組織替代、功能修復、衰老干預、疾病治療等一系列生命醫學領域的重要科學難題。面對科學數據的爆炸式增長，亟需建立以再生生物學為覈心的開放資料庫，以存儲世界範圍內的組學研究數據為基礎，推動再生相關的基礎研究和臨床轉化應用的不斷發展。
9月30日，中國科學院北京基因組研究所（國家生物資訊中心）鮑一明研究組、張維綺研究組和動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組合作在Nucleic Acids Research雜誌發表了題為“Regeneration Roadmap: database resources for regenerative biology”的論文，建立了再生生物學領域首個多組學資料庫Regeneration Roadmap。該資料庫從轉錄組、單細胞轉錄組、錶觀基因組及藥物基因組等不同層面綜合了再生相關數据集，涉及11個物種、36種組織類型，實現了不同條件下基因表達隨再生變化的彙聚融合，以及對不同層次組學數據的互動査詢和聯合比較分析。此外，資料庫收錄了基於已有文獻報導的再生相關基因集，使得用戶可以更加深入全面地瞭解特定基因或通路在再生生物學中的功能。
Regeneration Roadmap資料庫實現了對多物種再生相關的不同層次組學數據的收錄與綜合。作為一個持續更新的國際化資訊平臺，Regeneration Roadmap的建立為國內外再生生物學相關資料的統一匯交、集中存儲、安全管理、開放共亯以及前沿交叉研究和臨床轉化應用提供重要助力和支撐。該資料庫對用戶免費開放，相關運維團隊將對該資料庫進行定期維護與更新，不斷綜合更多的再生相關資料資源、匯交多層次組學數據。此外，該團隊於2020年建立了Aging Atlas資料庫，收錄和綜合了與衰老相關的不同層次多組學數據。現時Aging Atlas資料庫已服務來自全球25個國家的上萬名訪問者。Aging Atlas和Regeneration Roadmap資料庫將形成資源互補，共同推動衰老生物學和再生生物學的學科發展。
Regeneration Roadmap資料庫由中科院北京基因組所（國家生物資訊中心）、中科院動物所、中科院幹細胞與再生醫學科學資料中心、中科院幹細胞與再生醫學創新研究院、北京幹細胞與再生醫學研究院、首都醫科大學宣武醫院國家老年疾病臨床研究中心等機构合作完成。資料庫的建設得到了中國科學院周琪院士、中國科學院幹細胞與再生醫學創新研究院胡寶洋研究員、中國科學院北京基因組研究所（國家生物資訊中心）楊運桂研究員、任捷研究員，首都醫科大學宣武醫院國家老年疾病臨床研究中心王思研究員、中科院動物所宋默識研究員、的指導和支持。該項目獲得國家科技部、國家自然科學基金委、中國科學院和北京市等項目的資助。
論文連結
Regeneration Roadmap資料庫
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