近日,鄭州大學省部共建食管癌防治國家重點實驗室、鄭州大學第一附屬醫院王立東教授團隊和瑞典烏普薩拉大學陳興啟教授團隊合作,在腫瘤癌變分子機制研究領域取得新突破。該研究一反長期聚焦闡明細胞核染色質DNA與腫瘤發生關係研究的思路,發現位於細胞質內的染色質外DNA(Extrachromosomal DNA,ecDNA)與賁門癌關係密切。該研究成果以題為“Focal amplifications are associated with chromothripsis events and diverse prognoses in gastric cardia denocarcinoma”的論文在知名期刊《Nature Communications》發表。省部共建食管癌防治國家重點實驗室、第一附屬醫院趙學科博士、宋昕博士和烏普沙律大學邢鵬偉博士為共同第一作者,王立東教授和陳興啟教授為共同通訊作者。
該研究對比分析了賁門腺癌和賁門正常組織全基因組測序(WGS)和染色質外環狀DNA測序(circle-seq)數據,鑒定出ecDNA擴增子;證實1/3的局灶性擴增為染色體碎裂引起的;WGS中鑒定出大部分擴增子在ecDNA測序中得到驗證;發現所有局灶性擴增片段僅發生在癌細胞中。該研究還發現:賁門癌組織ecDNA中ERBB2基因的局灶性擴增和蛋白表達之間存在正相關;對1688例賁門癌組織ERBB2蛋白表達和生存關係分析發現,在生存期大於2年的賁門癌患者中,ERBB2蛋白高表達患者組生存期明顯優於陰性表達組;發現其中28例賁門腺癌組織ecDNA基因組的局灶性擴增的頻率(78%)與食管鱗癌非常相似(80%),但與遠端胃癌明顯不同(50%)。
該研究得到了國家科技部重點研發計畫、國家自然科學基金和瑞典烏普薩拉大學基金支持。