1、水綿、雙星藻、轉板藻（俗稱青泥苔）。多在天氣轉暖後，在漁池淺水處萌發，長成縷縷細絲紮在池底，直立水中。衰老時斷離池底，漂浮水中，形成團團亂絲，魚苗魚種誤入其中易被纏繞而死。大量藻絲漂浮水中，還會影響浮游生物生長，使池水變瘦，不利於魚類生長。
2、多甲藻、裸甲藻（俗稱紅水）。多發生在有機質多、硬度大、呈微鹼性的池塘中，它們對環境變化極為敏感，如當水溫和pH值突然改變時，就會大量死亡，產生甲藻毒素，使魚中毒死亡，溫度變化較大的季節應特別注意。
3、銅綠微囊藻，水花微囊藻（俗稱銅銹水）。這兩種微囊藻是常見的藻類，大量繁殖時則會造成危害。當大量藻體沉澱死亡時，微囊藻一方面會分解產生羥胺、硫化氫等有毒物質，另一方面還能分解耗氧而導致池水中嚴重缺氧。
4、水網藻。多發生於水質較肥的淺水魚塘中，旺盛的絲狀藻體集結於網帶，魚苗誤入網中常會因呼吸困難和無法攝食而死亡。
處理方法：
1、人工撈除法。對於池塘表面大量蓄積的藻類，可以使用人工方法撈除。
2、增氧法。安裝使用增氧機，對藻類有一定的抑制平衡作用。
3、生物法。適當搭配鰱、鱅等濾食性魚類，合理投餌施肥，使用細菌類水質改良劑
4、藥物法。
（1）放魚前使用生石灰徹底清塘。
（2）水綿發生後，可每畝每米水深使用除草劑撲草淨150-200克；也可用草木灰、生石灰撒向青苔泥上，或雨天后每畝每米水深用生石灰10-15公斤製成溶液潑灑。
（3）紅水發生後，每畝每米水深用生石灰15公斤製成溶液全池潑灑，以提高池水的pH值，使這些藻類死亡，然後換進新水。
（4）使用每立方米水體0.5-0.7克硫酸銅遍灑殺滅藻類，2天后再換進1/3的新水。
（5）須注意的是，藥物殺死藻類後，大量死亡的藻類腐爛易造成池塘水質變壞，導致水體嚴重缺氧，需要使用增氧機增氧或加注大量新水。密切注意魚群和水質變化，以便及時注入新水或採取增氧等措施。藥物本身毒性很大，這種方法應謹慎使用。