普通CT掃描採樣時間長，影像易受呼吸影響，對肺栓塞診斷幫助不大，螺旋CT可使病人在一次屏氣的短時間內完成CT掃描，可清晰地顯示主肺動脈和葉肺動脈中的栓子，對一部分段或亞段肺動脈也可較好地顯示。
急性肺動脈栓塞最可靠的徵象是血管中心充盈缺損，周圍有對比劑環繞，中心充盈缺損與血管壁呈銳角，急性肺栓塞偶可表現為血管突然完全截斷，並伴血管擴張，慢性肺栓塞常常表現為充盈缺損，邊緣光滑且與血管壁呈鈍角，慢性小血管的肺栓塞可表現為管腔的閉塞，Rathbun等對自1986年至1999年發表的有關螺旋CT診斷肺栓塞的文章進行分析，發現螺旋CT診斷肺栓塞的敏感性為53%～100%，特异性為81%～100%，均高於放射性核素通氣-灌注掃描（分別為49%和74%），Rathbun的研究尚表明根據螺旋CT陰性檢查結果而停用抗凝治療的安全性尚不確定。
螺旋CT除了可直接顯示栓塞血管方面優於放射性核素掃描外，尚可顯示肺內對診斷肺栓塞有輔助價值的徵象，如楔狀，條帶狀和線狀密度增高陰影或肺實變征，現時許多研究認為對臨床懷疑為肺栓塞患者應該選擇螺旋CT，而不是以傳統的核素通氣-灌注掃描作為過篩性診斷檢查，一些研究尚表明螺旋CT與肺動脈造影在診斷肺栓塞的敏感性和特异性方面並無差异，儘管螺旋CT診斷段以上肺動脈栓塞是相當準確的，然而CT用於肺小動脈栓塞的診斷尚處於未成熟階斷，現時還無法取代肺動脈造影。