由於兒童正處於生長發育階段，細胞增殖旺盛，對x射線更加敏感，而且兒童的預期壽命更長，故其潜在危害也更大。年齡越小，輻射誘發癌症的可能性越大，並且兒童體積小，周徑和前後徑均較成人小，在相同的CT檢查條件下，其接受照射劑量更多。
近年來，對於兒童CT檢查受照劑量和輻射危害的評估仍侄進行，比較一致的結果是：若用成人的掃描條件給兒童做CT檢查，其接受的輻射劑量至少為成人的2倍，而現時普遍的情况是醫師並未針對兒童採取最優化的掃描條件。現時，研究較多的項目是適用於兒童CT檢查的低劑量掃描方案的定義和製定。兒童行頭顱CT時所接受的輻射劑量較大，對兒童敏感組織（如：甲狀腺、眼晶體等）的輻射危害大，囙此，對這方面的輻射防護研究也頗多。但是，國內仍沒有針對兒童而設定出一定的最佳掃描條件，或是規定適合不同年齡段兒童的CT檢查參數。由於這方面的研究認識還比較局部、零散，且並未真正的系統化，所以參攷價值也大大降低。現時比較一致的做法還停留在一些遮罩防護方面。接受過放射防護培訓的醫師、X射線工作者，他們可能會有意識地調節掃描參數，降低兒童不必要的受照劑量。但是，大部分醫師並沒有這方面的防護知識，這對兒童來說，無疑新增了他們受照後的潜在輻射危險。