心臟病分為先天性和後天性心臟病，還可以分為心臟瓣膜病、心肌病、心內膜病、心包病和主動脈和肺動脈病等。超聲檢查心臟的主要目的是解剖診斷看心臟結構，病因診斷看什麼原因引起的心臟病，功能診斷看心臟舒張和收縮泵功能怎樣。
不同病因的心臟疾病均會引起心臟的解剖結構、形態功能變化，超聲心動圖可以進行解剖診斷：瞭解心腔本身、心臟與大血管的結構、位置、大小變化，心肌、心內膜、心包厚度和回聲、瓣膜腱索乳頭肌形態結構和運動變化，血管管壁厚度、回聲、搏動等等，對先天性紫紺和非紫紺性心臟病、心肌疾病、瓣膜病的進行診斷。
現時超聲心動圖及彩色多普勒的應用，使近90%的先天性心臟病可以得到明確診斷，而免於導管及選擇性心血管造影的檢查。但僅僅依靠超聲心動圖而忽視體檢及其他資料的綜合分析，亦可造成錯誤診斷。