孫恩之亂是東晉末年發生的一次民變事件，其中歷時約十一年。那麼孫恩之亂的具體經過是怎麼樣的？下麵小編為大家詳細介紹一下相關內容。
初襲會稽
孫恩先與部眾登入進攻上虞（今浙江上虞），殺上虞縣令，接著就進攻會稽郡城山陰（今浙江紹興），又殺太守王凝之。由於三吳地區少有戰亂，人們都沒備戰，故此各郡縣的駐軍都望風潰散。吳國內史桓謙、臨海太守司馬崇及義興太守魏隱都弃郡城出逃。
而當時會稽、吳郡、吳興、永嘉、義熙、臨海、東陽及新安共八郡都同時有人舉兵響應孫恩，很快孫恩的部眾就暴增至數十萬人。孫恩在會稽自稱征東將軍，強逼人們跟隨自己造反，將他的團體叫做“長生人”，又大行殺戮及四處放火、搶掠。
由於當時三吳地區已成東晉朝廷的命脈，東晉朝廷即命徐州刺史謝琰率軍討伐孫恩，兗州刺史劉牢之亦率軍進攻三吳。謝琰先下義興郡，迎太守魏隱還郡，後又擊敗吳興郡的孫恩部眾，與劉牢之兩軍共進之下，很快就兵臨錢塘江。
孫恩初時自以為能乘八郡響應的聲勢拿下建康，但至劉牢之率軍渡過錢塘江時，孫恩就帶著二十萬部眾東走，並乘劉牢之軍隊搶奪部眾留下的人口和貨物時爭取時間逃走，終逃到海島之上。接著孫恩於各郡的餘部都被消滅，朝廷因為擔心孫恩會再來襲，於是留謝琰駐防會稽。
再襲會稽
孫恩於隆安四年（400年）再次進攻，並進軍至離山陰三十五裏的邢浦。謝琰雖然一度派劉宣之擊退孫恩，但不久孫恩又再來攻，並擊敗晉軍，終於五月己卯日（7月7日）攻至會稽，謝琰出戰但戰敗，反被帳下督張猛所殺。朝廷對謝琰戰死大為震動，又派了冠軍將軍桓不才、輔國將軍孫無終及寧朔將軍高雅之抵抗孫恩，戰事一直持續到十一月，劉牢之率軍進攻孫恩，逼其再次撤回海島。
北逼京邑
隆安五年（401年）二月，孫恩再度登入，進攻句章（今江蘇寧波市），為劉牢之所敗，又再撤回海上。孫恩於是轉攻北面的海鹽（今浙江海鹽）。晋將劉裕於是到海鹽築城抵抗，並屢次擊敗孫恩。孫恩知道無法取勝，於是改攻滬瀆。吳國內史袁山松於上一年就已修築滬瀆壘（今上海）以抵禦孫恩進攻，但孫恩還是攻下了滬瀆壘，四千人戰死，袁山松亦遇害。
六月甲戌日，孫恩循海道到達丹徒縣（今江蘇鎮江市丹徒區），時已有十多萬兵，千多艘樓船。孫恩臨近的行動震動了建康，朝廷次日就下令建康內外戒嚴，百官入居臺省，城內各軍亦駐守要地[7]，豫州刺史司馬尚之也率軍入衛建康。孫恩在丹徒登入，卻遭自海鹽追來的劉裕率軍擊敗，更有很多人墮崖遇溺，孫恩亦只得逃返船上。
孫恩仍自恃部眾人數多，於是不久就决定重整旗鼓進攻建康。建康群眾知孫恩逼近都十分恐懼，而孫恩原想攻其不備，但樓船因為遇風而要慢行，令到臨近建康時司馬尚之已經入駐建康，劉牢之亦自會稽趕來。孫恩於是不敢繼續前進，反北走鬱洲（今江蘇灌雲縣東北），解除了建康的危機。
轉衰至敗
及後劉裕率兵討伐，多次戰鬥後大破孫恩軍，孫恩實力於是由盛轉衰，被逼沿海退走，劉裕亦率軍追擊，於十一月在滬瀆、海鹽再敗孫恩，孫恩人員的損失數以萬計，被逼再次退守海島。元興元年（402年），孫恩再攻臨海郡，臨海太守辛昺擊敗孫恩，孫恩眼見他的部眾已經所餘無幾，為免被晉軍生擒，於是投海自殺，時有數百人隨他一同自殺，孫恩之亂至此結束。