1、損害腎功能，誘發癌症：孩子包皮過長的危害引發生殖炎症，病菌上行進而感染腎臟，長期不治將會損害腎臟功能。此外，包皮垢還是一種致癌物質，是導致男性陰莖癌的因素之一。
2、影響陰莖發育：由於龜頭被包皮緊緊包住，陰莖發育受到束縛，致使陰莖的長度和直徑明顯小於同齡男性。成年後還容易發生包皮嵌頓、包莖，嚴重者可導致龜頭壞死。
3、滋生病菌，引發生殖炎症：孩子包皮過長的危害容易藏汙納垢，滋生大量病菌。病菌侵襲尿道可造成尿路感染，可引發包皮炎、龜頭炎、尿道炎等生殖炎症，還可新增生殖器疣病、皰疹等性疾病的感染幾率。
4、容易引起手淫。包皮過長產生的包皮垢及包皮炎的刺激，容易引起孩子手淫的行為。
5、易致孩子婚後不育。包皮過長沒有得到處理，由於包皮垢感染而引起的前列腺炎，可影響精液中精子的活動力和精液的粘稠度，可造成孩子以後生育受影響。