佛珠是弘法最為方便的法器，所以歷來的大德高僧，莫不巧用佛珠。在經典當中特別強調，持用不同質料的佛珠，其念誦的功德利益，也有勝劣的差异，如在《佛說較量數珠功德經》中，佛告諸福斯言：
汝等善聽我今演說，受持數珠校量功德獲益差別若有誦念諸陀羅尼及佛名者，為欲自利及護他人，速求諸法得成驗者。其數珠法應有如是須當受持。若用鐵為數珠者，誦掐一遍得福五倍；若用赤銅為數珠者，誦掐一遍得福十倍；若用真珠珊瑚等為數珠者，誦掐一遍得福百倍；若用木子為數珠者，誦掐一遍得福千倍；若求往生諸佛淨土及天宮者，應受此珠。若用蓮子為數珠者，誦掐一遍得福萬倍；若用因陀也嫖數珠者，誦掐一遍得福百萬倍；若用烏賜也嫖數珠者，誦掐一遍得福千萬倍；若用水精為數珠者，誦掐一遍得福萬萬倍；若用菩提子為數珠者，或用掐念或但手持，數誦一遍其福無量，不可算數難可校量。
此外，在《攝真實經》卷下“建立道場發願品”《守護經》及《瑜伽念珠經》中，均以菩提子珠的功德最為殊勝。那麼人們不禁要問：為什麼菩提子珠具有如此大的功德呢？在《曼殊室利咒藏校量數珠功德經》裡邊，文殊菩薩為福斯講述了一段佛陀往昔因地當中的一段故事，以釋群疑：
以何因緣我今偏{用菩提子獲益最勝，曼殊室利菩薩言：乃往過去有佛出世，在此樹下成等正覺。時一外道邪見壞心譭謗三寶。彼有一男忽被非人之所打殺。外道念言我今邪見，未審諸佛有何神力，如來今既在此樹下成等正覺，若其實聖，樹應有感。即將亡子臥菩提樹下，作如是言：“佛樹若聖，我子應蘇。”以經七日，誦念佛名，子乃重蘇，外道歡喜。贊言：“諸佛有大神力，我未曾見，佛成道樹現此希奇，甚大威德，難可思議”。時諸外道聞此事已，渦肮檎發大菩提心。信佛神力不可思議。以此因緣，世人皆號為延命樹。其菩提樹遂有二名，一名菩提樹，二名延命樹。
不管怎樣說，選擇一串菩提子的佛珠，在心中念誦一些經文，咒語，或佛菩薩的聖號，可以軀除煩惱，消除報障，新增智慧，利已護人，對於幫助我們的修行，實在是大有裨益。