黑曜石和黑瑪瑙同屬黑色系的治療石,外表均呈黑色。普通黑曜石不透明,黑瑪瑙為半透明,黑曜石表面有反光,稍變色,瑪瑙對光線的反應不明感。
從硬度上來看,黑曜石硬度在5.3左右,黑瑪瑙在7左右。從手感上來感覺,黑瑪瑙要比黑曜石壓手一些,黑瑪瑙瑪瑙手感有點溫潤的感覺,黑曜石的手感比黑瑪瑙凉。
從光澤上看黑瑪瑙有自然光照射時會是銀白色的反光,而且反光會像鏡面一樣的效果,黑曜石則沒有這種反光效果。
黑曜石表面會有天然的條紋或斑點,彩虹眼黑曜石有些條紋呈橢圓形狀,黑瑪瑙的紋理表現上沒有明顯的橢圓環形,少部分天然瑪瑙中內有結晶狀態,如條帶狀、斑點狀及緻密塊狀。
如果身邊有强光手電筒,用强光手電筒照射黑耀石會發現黑耀石的顏色不是黑色,而是深褐色或深褐黃色,而黑瑪瑙則沒有這種顏色的變化。