沉香在日本也有著悠久的歷史，並且對其有著深入的研究，特別是近現代以來利用現代科技手段對沉香的分析，相關論著多來自日本，而日本的傳統用香管道也一直保存了下來，逐漸演化為極具特色的香道，獨立世界藝術之林。下麵就一起看看沉香在日本的使用與研究吧。
傳統用香
沉香的傳統用香多源於中國，鑒真東渡時帶去了佛法，也帶去了沉香。日本用香最初受唐朝影響較多，《源氏物語》中就多有描繪平安時代的王室貴族們像唐朝貴族們那樣舉辦香會，品香、鬥香。
燒香：將沉香、檀香、丁香、龍涎香等七到十種香料混合在一起放在碳上燃燒，供奉在佛龕之中。
香：包括沉香在內的多大二十種香料磨成粉，通過加入蜂蜜或梅肉作為粘結劑經手工揉搓成丸，密封在瓷罐中，埋入土中保存至少三年的時間。在土中的醇化時間越久，香味越濃郁。
線香：在日本最常見的香製品，不同的燃燒時間長短粗細各异，沉香含量和等級的不同，價格高低有別。類似的還有香錐和香袋。
其實不難看出，日本用香和中國傳統用香在形式上並無不同，很多只是細節上的差异，不過在合香時引入中醫的理念，將香藥用是中國特色。
醫藥應用
沉香是香，也是藥材，中醫對其早有應用。不過，對於沉香中的成分分析，日本的研究要多一些。現代對沉香、奇楠的深入解析，更多會參攷日本的一些著述。據占全日本沉香進口總量約20%~30%份額的知名沉香進口商的統計，每年約有20%的來自馬來沉香進口沉香被用於醫藥行業，估算用量不超過一噸。醫藥行業使用的沉香比宗教和文化用途的沉香級別要低。
總的來說，無論在日本還是在中國，無論過去還是現在，最被人們津津樂道的還是沉香的香氣，在現代製藥中沉香可以有著眾多的替代品，而用於宗教和文化，沉香的地位始終無可替代。（《為什麼沉香名品要選擇正產區的？》）