1.顏色：獨山玉顏色很複雜，單一色調出現的玉料不多，多由2或2種以上色調組成，顏色產生常與所含Cr3+、Fe2+、Mn2+、V2、Ni2+等色素離子有關，且表現為依附於帶色的各種蝕變礦物中，其中綠色同陽起石、鉻雲母、綠泥石有關，淡紅色與黝簾石有關，黃色與綠簾石有關。獨山五顏色複雜多樣，在玉石上分佈表現為二：一是各色相互浸染交錯，雜亂無章，另一類表現為大致呈平行帶狀展市，且有色相、濃度上表現為呈漸變的關係。一般依據顏色不同，可以把獨山玉劃分成綠、白、紫、黃、雜色五大類，獨山玉主要以綠色為主，綠色表現為兩類：其一為透明度較好者，其顏色為暗綠色、藍綠色、黑綠色，且藍味較重；其二為不透明者，其綠色多為淡綠色、黃綠色，偏黃味；二者綠色欠正。
獨山玉顏色的雜亂給其選礦分級帶來了困難，與翡翠相比，大多數顏色沉悶，優質料少，但是另一方面，由於獨山玉色彩斑斕，白綠相間，又加以黃，黑、紫等色，極適合玉雕製作表現，若巧用消色，可成為俏色優質產品，其中色鮮豔者亦可做首飾。
2.質地：由於獨山玉由多種礦物成分組成，與翡翠、軟玉有相近的成分，它的質地近似於軟玉和翡翠，具有堅韌緻密細膩的性質，如脂白似白雲，翠綠似翡翠；但總體來說，它的質地不如軟玉和翡翠的質地潔淨，顯示了獨山玉質地複雜性。
3.透明度：由於獨山玉內部結構及組成成分的差异，它的透明度從半透明、微透明到不透明都可以見到。例如同是白色有透水白玉和幹白玉，透水白玉透明度好，主要由細微性小於0.01毫米的斜長石組成，顆粒大小均勻，結構緻密，質地細膩；而幹白玉含有大量黝簾石，且細微性大，分佈不均勻，質地粗糙。
4.裂綹：獨山玉中的有兩種成因：一種是原生裂綹，因各種地質作用，將原石割裂成小碎塊；另一種是開採加工過程中，受力作用而產生的的次生裂綹，無方向性；裂綹影響玉石的自然塊度大小和加工製作。
5.雜質：獨山玉中常分佈一些污點或暗色礦物的零星殘餘，俗稱“灰星”，若有“灰星”，對玉石工藝品的美觀和潔淨度都有影響，原石中還存在。