對患者的隨訪和監測是乙肝臨床治療計畫的重要部分，極為重要，不能忽視。持續轉氨酶正常且HBV-DNA例性者，應每6個月進行HBV-DNA、轉氨酶、甲胎蛋白和B超檢查；轉氨酶正常但HBV-DNA陽性者，應每3個月檢測1次HBV一DNA和轉氨酶，每6個月進行甲胎蛋白和B超檢查；如有可能，應作肝鉏織學檢查。
（1）慢性乙肝病毒攜帶者：這是指HBsAg和HBV-DNA陽性，e抗原或e抗體陽性，轉氨酶在正常範圍者。應至少每年檢查2~3次肝功能，1~2次乙肝血清病毒標誌、HBV-DNA和甲胎蛋白，並應動員其做肝穿刺檢查，以便進一步確診並做相應治療。
（2）慢性乙型肝炎患者：當轉氨酶持續正常，且HBV-DNA陰·性時，建議每6個月檢查1次HBV-DNA、轉氨酶、甲胎蛋白和B超；對轉氨酶正常但HBV一DNA陽性者，建議每3個月檢查1次HBV-DNA和轉氨酶，每6個月進行1次甲胎蛋白和B超檢查。
乙型肝炎肝硬化者，特別是原度性肝細胞癌高危患者（大於40歲，男性，嗜酒，肝功能不全或已有甲胎蛋白增高），應每3~6個月做甲胎蛋白和腹部B超檢查（必要時作CT或磁共振），以盡早發現肝癌。此外，每1~2年還應進行胃鏡檢查或上消化道×線造影，以觀察有無食管胃底靜脈曲張及其進展情况。