體長區別：成年以後的母孔雀魚體長可以達到6- 8釐米，公孔雀魚的體長只能達到3-4釐米。外觀區別：公魚顏色鮮豔，魚鰭比較大，尾鰭有漂亮的花紋。母魚顏色單一，魚鰭短小，尾鰭很少有花紋。腹部區別：母魚的腹部是透明的，可以看到肚子裡面的顏色。公魚的腹部是白色的，看不到裡面的顏色。
一、孔雀魚如何區分公母
1、體長區別：孔雀魚成年以後可以按照體長來判斷公母，一般只有母魚的體長可以達到6- 8釐米，公魚的體長只能到3-4釐米。飼養者可以根據孔雀魚的大小來判斷，但是這種判斷不是最準確的，因為有的公魚體質較好也可以長到5釐米左右，而有的母魚體質較差，也有可能只長到4-5釐米。
2、外觀區別：飼養者也可以根據體色來判斷公母。孔雀魚公魚的顏色比較鮮豔，色彩繁多，而且魚鰭比較長，尾鰭上還會有圓形的花紋，像孔雀羽翎一樣，非常漂亮。母孔雀魚相對來說顏色就比較單一，一般只有銀灰色或藍灰色。母魚的魚鰭也比較短，尾鰭的色彩和花紋也不明顯。在成年後，公孔雀魚的臀鰭會長出生殖足，母魚的臀鰭不會發生變化。
3、腹部區別：母孔雀魚的腹部是透明的，可以看到肚子裡面。而公孔雀魚的肚子是白色的，無法看到肚子裡面。
二、孔雀魚多大可以區分公母
一般來說，孔雀魚在出生後的一個月左右就可以區分公母了。幼魚區分公母，可以先看發色速度，一般發色較快的就是公魚。