淨化水質：這是硝化菌最主要的作用。它們可以分解水中的有機物，從而起到清理雜質、改善水質的作用。降低水中氨濃度：如果水中含有比較多的氨氣，會對魚類的健康造成危害。而硝化菌則可以清除氨氣的作用。調節水中微生物平衡：水中的微生物種類很多，硝化菌可以起到調節平衡的作用。
一、硝化菌的作用是幹什麼的
在養魚的時候，硝化菌可以用來建立硝化系統，這個系統可以起到的作用是非常多的：
1、淨化水質：硝化菌的主要作用就是淨化水質。在養魚的過程中，保持水質良好是一個重要的任務。除了換水之外，還有一個好方法就是使用硝化菌。硝化菌可以分解一些有機物，將水中的雜質清理掉，起到改善水質的作用。
2、降低水中的氨濃度：在養殖池或者水中有時候會有比較多的氨氣，這些氨氣會對其中魚類的健康造成比較大的危害。此時，硝化菌就可以起到降低水中氨濃度的作用，避免氨氣對魚造成太大的影響。
3、調節水中微生物平衡：水中含有許多品種的細菌，維持水中的微生物平衡是非常重要的，硝化細菌就可以起到這樣的作用。
二、魚缸硝化細菌有必要加嗎
在養魚之前，可以在魚缸中放入一定的硝化細菌，等這個系統建立完善之後再養魚。也可以不人工加入，讓它們自然形成，不過有時候形成一個完善的系統是比較困難的，花費的時間也是比較長的。囙此，建議還是在魚缸中加入一些硝化菌，這樣建立系統就比較容易了。在這個系統建立之後，沒有特殊的情况就不用重新加入硝化細菌了，因為它們是可以自己繁殖的。不過在環境突變的情况下，也就是系統被破壞的情况下，也需要重新建立。