1.非典型自閉症（AtypicalAutism）
它與自閉症不同處在於發病年齡，或無法符合上述自閉症A和B所有的診斷條件。這些病人的自閉症狀在三歲後才表現出來（即A項條件不符），或自閉症的B項症狀全部未達6項，或1.未達2項，或2.或3.並未出現，譬如同一性行為不明顯（即B之3.不符），或社交缺陷沒有嚴重到完全符合自閉症的診斷標準（即B之1.不符），或語言溝通正常（即B之2.不符）。非典型自閉症可見於極重度智慧不足患者，由於其功能非常低以致無法表現出診斷自閉症所需的特定偏差行為；此類病人有些醫生將他們診斷為智慧不足並有自閉傾向。有些高功能的自閉症患者，到學齡期部分症狀改善或消失，無法完全符合自閉症診斷要件，亦歸於非典型自閉症。有些嚴重接受性語言發展障礙患者，也常表現出仿說現象，以及社交、情緒、行為上和自閉症類似的現象，也就是和自閉症的診斷有重疊之處，也合乎非典型自閉症的診斷。在ICD-10，將非典型自閉症再分為發病年齡非典型、症狀非典型、和發病年齡及症狀均非典型。DSM-IV則將此亞型擴大包括非典型自閉症及其它無法歸類的PDD，命名為「未明示之PDD，簡稱PDDNOS」。
2.雷特症候羣（Rett’sDisorder）
這是一種絕大部分發生於女童，以癡呆、自閉現象、痙攣、小頭和喪失有目的的手部動作為主要特徵的症候羣。典型的個案出生後之前五個月有正常或近乎正常的早期發展，在5至30個月之間發病退化，喪失全部習得的手部和語言技巧，同時在5至48個月之間開始頭部生長減緩而成小頭。喪失有目的的手部動作，代之以固定反復的手部動作（如，搓手、扭衣角）及過度換氣（深呼吸）是其特徵。社交及遊戲的發展停滯，但仍有視線接觸，有些病人後來社會互動會進步。在兒童中期常發展出協調不佳、步態不穩，且合併有駝背或脊柱側彎，有時會有舞蹈徐動症狀。病人都會有嚴重的智慧障礙，在兒童期早期或中期也常出現癲癇痙攣。與自閉症不同的是，少見嚴重的自我傷害及複雜的重複性偏好或常規的同一性行為，主要是越來越嚴重的運動功能退化和智慧退化。
3.兒童期崩解症（DisintegrativeDisorder）
它為廣泛性發展障礙的一種，也稱為崩解型精神病或海勒氏病。這類兒童至少在二歲前仍有正常發展，在二至十歲間發病，最常見的是三至四歲發病，發病後喪失已習得的技巧，同時合併和自閉症相同的社會功能和溝通功能質的异常。通常呈現明顯的語言退化或完全喪失，遊戲、社交技巧及適應行為退化，常見大小便失去控制，有時會有運動功能的退化。病人對周遭環境失去興趣，出現重複的作態性動作，及類似自閉症的社交互動及溝通障礙。病人男女均有，但以男童居多。其病程是開始退化後大都在六至十八個月之間退化到最壞的地步，此時與低功能自閉症患者難以區分。部分病人退化到最壞的穀底之後，會逐漸恢復部分功能，但部分病人則持續退化，後者可能有神經系統的病變，應予以檢查治療。
4.亞斯柏格症候羣（Asperger’sDisorder）
1944年亞斯柏格在德國報告和自閉症非常相似的症候羣，不同的是病童先會講話後會走路（自閉症則語言發展嚴重落後），且語言近乎正常，此外，二者在人際關係及同一性特徵幾乎完全一致。有部分學者至今仍認為亞斯柏格症是高功能自閉症中很特殊的一群而不需單獨分類。這類兒童通常無顯著的語言或認知發展遲滯，但社互動動質的障礙及局限、重複及同一性行為、興趣及活動則與自閉症相同。病人可能有與自閉症類似的溝通問題（語用缺陷），但沒有顯著的語言遲滯和文法上的缺陷。大多數個案一般智慧正常，但動作常顯得笨拙。這個症候羣主要發生於男童（約8比1）。此種异常多半會持續至少年期及成人期，而成為一種特殊人格，且其攻擊行為的出現率較自閉症患者為高。