萬曆三大征指明神宗萬曆（1573年-1620年）年間，先後在明朝西北、西南邊疆和朝鮮展開的三次大規模軍事行動：寧夏之役、朝鮮之役和播州之役統稱為“萬曆三征”。
李如松圍困寧夏城
寧夏之役（1592年）的禍首是一個叫哱拜的蒙古人。哱拜原本是蒙古韃靼人，因為得罪酋長，父兄慘遭殺害，走投無路時選擇投靠大明。生活穩定以後，哱拜非但沒有對明朝的援助知恩圖報，反而以怨報德，聯合蒙古各部在寧夏叛變。
萬曆帝當時毫不猶豫派兵圍剿，但是沒有想到養虎為患，哱拜的叛軍勢力已經很强大，蒙古部落也在支持他們，囙此平定哱拜叛亂遇到了不小的阻力。於是萬曆帝派出身將校之家、足智多謀的李如松來平定叛亂，並任命他為寧夏總兵。此外，還從遼東，浙江及山西等地調兵圍剿哱拜，大明的軍隊將寧夏城團團圍住，並在李如松的指揮下採用水淹寧夏城的戰畧。沒有外援支撐，寧夏城很快便被攻破，叛軍首領哱拜自知毫無退路，便帶著全家自殺。
朝鮮之役（西元1592年—1598年）的戰場位於朝鮮半島，當時日本號稱“戰神”的豐臣秀吉攻打朝鮮，並且將朝鮮打得一敗塗地，朝鮮便向明朝求援。萬曆帝與內閣大臣幾經商量後，决定支援這場海外戰爭。
明朝最初派史儒馳往平壤救援朝鮮，當時朝鮮情况危急，全國八道盡失，僅剩平安道（八道之一）以北，靠近遼東半島義州一帶尚未被日軍佔領。明軍無論是戰鬥力還是軍備上都佔有優勢。但最初與日本在平壤第一次交手時候，因不諳地形又遭逢大雨，明軍首戰失利。
隨後萬曆帝派李如松增兵朝鮮，在平壤與日本第二次交戰中，明軍力壓日本。碧蹄館之戰中明軍三千騎兵打得數萬日軍寸步難行。西元1598年，豐臣秀吉忽然病死，朝鮮戰爭結束。明朝大軍不僅打敗了日本，還把日本戰神豐臣秀吉消耗至死，使日本從此不敢再輕易染指朝鮮。
播州之役（西元1596年—1600年）是一場明朝中央政權與地方勢力奪權的戰爭。西南地區長久以來都是帝國統治者比較頭疼的地方，一來西南地區歷史文化悠久，二來土司等地方勢力根深蒂固，歷朝歷代在對待西南地區的問題時都煞費苦心。
明朝建國後，一直都想分化瓦解西南地區土司的勢力，於是便在西南地區實行改土歸流，到了萬曆時期成效顯著。但土司楊應龍對明朝政府壓制十分不滿，於是便發動叛亂。
萬曆帝派李化龍平定楊應龍叛亂，起初因為明朝四川的兵力主要部署在朝鮮戰場上，所以在對楊應龍的圍剿中部署不够周全，再加上楊應龍的軍隊先是佯敗，誘明軍深入後設下埋伏，明軍中計大敗。
萬曆二十七年（西元1599年）明朝結束了朝鮮戰場，萬曆帝集中力量剿滅楊應龍。萬曆帝從四川、貴州、湖廣等八省調兵，出兵人數達到24萬，李化龍分兵圍剿楊應龍，大敗叛軍。楊應龍最後兵敗自縊身亡。此後西南地區政權牢牢抓在明朝政府手中。
明朝名將李如松
“萬曆三征”前後持續了差不多八年時間，“寧夏用兵，費帑金二百餘萬。其冬，朝鮮用兵，首尾八年，費帑金七百餘萬。二十七年，播州用兵，又費帑金二三百萬。三大征踵接，國用大匱”。“萬曆三征”的軍事開支居然達到了驚人的一千一百六十餘萬兩白銀，致使國庫空虛，於明朝而言是一個不小的負擔。不過比起國家安定和統一來說，萬曆三征的歷史意義還是十分重大的，明朝的軍事力量也在萬曆時期達到頂峰。