常溫保存
若將較新鮮的檸檬直接放在常溫下保存，約可保存一個月。但要保證儲存區域裏的氧氣濃度不可過低，且二氧化碳濃的量不能太多，以免影響檸檬口味。另外多說一句，購買時應選擇外皮較硬且緊實、分量足够足的檸檬，保證其發育良好，以便於儲存。
檸檬汁保存
檸檬汁榨好後可用保鮮膜封住杯口後放入冰柜冷藏室中存放，但為了避免其中的維他命C揮發，應儘量在3天之內飲用完。
切片後直接保存
將檸檬洗淨後切成一片片的，切好之後加入適量蜂蜜，然後直接密封保存在器皿中。這時候再放進冰柜裏封存，大概可保持一個月的新鮮。
醃漬保存
將它們洗淨後切好，加入白糖或冰糖，加以醃漬。食用時可將檸檬片取出，泡水飲用。
拿塑膠膜密封
第一次沒全部吃光的情况下，可將多出的用保鮮膜將其表面覆蓋完全後置於冰柜冷藏室內。但為了保證口感與功效，仍建議最好在短時間裏趕緊將其吃完。
綜上，我們瞭解了檸檬的諸多保存方法，但是無論哪種方法，隨著時間的流逝，檸檬的價值都會有一定程度地流失。囙此，為了盡可能高地保留檸檬的高營養價值，還是應當儘快食用。