因為，中國和菲律賓只隔了一個南海，所以，從古代開始，菲律賓就是華人移居的選擇地之一，感興趣的讀者可以跟著小編一起往下看。
自從明朝初年鄭和下西洋以後，中國的名聲就在外傳開了，菲律賓的呂宋和蘇祿等國都與中國保持著間斷性的貿易往來。到了十六世紀七十年代，越來越多的華人選擇移居菲律賓。當時，中國已經開放了部分地區的海禁，而西班牙剛殖民菲律賓，對商品和勞動力的需求很大。
在這樣的背景下，晚明和西班牙在菲律賓地區產生了許多衝突。
1565年，西班牙侵入菲律賓，攻下了宿務島。1571年，西班牙向呂宋發起進攻，成功建立了馬尼拉城。
在殖民統治初期，為了博得民心和促進菲律賓與中國的貿易往來，西班牙對移居菲律賓的華人採取懷柔政策。但是，隨著華人在菲律賓擁有越來越大的社會影響力和越來越多的話語權後，西班牙與華人開始產生了分歧。1574年，旅菲華僑與西班牙衝突尖銳，並爆發了一場武裝鬥爭。
活躍於福建附近的商人林鳳帶頭起義，反抗西班牙殖民者的統治。在這次起義中，他們不僅把西班牙兵打得節節敗退，還險些攻下了馬尼拉，大大震驚了西班牙殖民者。1593年，菲律賓總督前去摩鹿加群島進行訪問時，因為，菲律賓的勞動力不足，便强行抓了一些華人充當槳手。
在路上的時候，本來對此就極度不滿的華人，還遭受著總督一行人的打罵。於是，華人們决定奮起反抗。在達斯馬里納斯的船上，華人們聯合起來把包括總督在內的西班牙人都殺了，只有十二個阿兵哥裝死才逃過一劫。發生這件事後，馬尼拉政府十分恐懼，便掀起了一陣排斥華人的浪潮。
於是，為了保障華人權益，福建官員帶著一支搭載著阿兵哥和裝滿武器的中國船隊，遠航到馬尼拉，接回了三千餘名在菲華人。
到了1603年的時候，菲律賓出現了一個傳言：中國皇帝想搶佔菲律賓的黃金，現在正準備出兵攻打菲律賓。這一傳言來源於一名呂宋木匠：呂宋有一座山，山上會自動長金豆。萬曆皇帝得知後，以為這件事是真的，於是，便派了幾名福建官員前去瞭解事情真假。
但不曾想，他這樣的做法卻證實了謠言。如此一來，本就十分忌諱中國的西班牙更是害怕，它擔心中國想開拓國土，跟自己爭奪菲律賓。在這種情況下，西班牙越來越排斥華人，甚至，產生了殘害或屠殺華人的想法。當時，察覺到了西班牙意圖的華人不願意任人宰割，他們要掌握自己的命運。
於是，華人聯合起來，搞了一場大起義。但可惜的是，因為缺乏武器和軍事理論的指導，他們僅僅堅持了四十天就宣佈起義失敗。之後，為了懲罰華人，西菲當局召集各方勢力發動了一場對華大屠殺。據統計，至少有兩萬華人死於這場屠殺。通過這場屠殺，在菲華僑的數量大大减少了。
據《菲律賓華僑叛亂實錄》的作家說：大屠殺後，“八聯”已成灰燼，僅剩四百人。又有一文獻說：大屠殺後，馬尼拉地區只剩下華僑四百五十七人。另一估計說：生者不足八百。同時，這場大屠殺也給菲律賓的經濟帶來了致命一擊：嚴重缺乏物資，經濟更呈現下滑趨勢。
西班牙殖民主義強盜立刻發現：沒有理髮師、沒有裁縫、沒有鞋匠、沒有廚師、沒有農民和牧民：“沒有糧食吃，沒有鞋子穿，即使出極高的價錢也買不到”。這些人自己也供認：“華僑乃所有行業的從業人手，是以合理的工價從事勞動的優秀勞動者，沒有華僑，菲律賓是不可能維持得下去的。”
因為，當時菲律賓的經濟發展和貿易往來，全靠華人的努力和貢獻。所以，隨著時間的流逝，菲律賓的情况越來越嚴重。後來，西菲當局竟然要向外借貸來維持國家的運轉。
對此，西班牙人十分擔心：
一、如果中國商船不再來菲律賓了，那麼，美洲會不會受到影響？
二、明朝廷得知此事後，會不會出兵菲律賓搞報復？在巨大的壓力下，西菲當局連忙加强軍事防禦以作應對。但是，士兵們普遍心情低落，士氣不佳，且軍糧嚴重不足。就這樣，西班牙殖民者在無盡的恐懼中等待著中國給予他們懲罰，整個馬尼拉都被絕望與孤寂籠罩著。1604年，一些富人終於忍受不了這樣的生活，便帶著全家遷離了馬尼拉，前往墨西哥去了。
最終，為了挽回政局，西班牙駐菲總督採取了一些緊急措施：一方面，他歸還部分財產給華僑商人，讓屠殺行動的倖存者寫信回國內，希望以此來“洗白”西班牙的罪行；另一方面，他寫了幾封致廣東、福建官員的信件，讓使者奎瓦帶著去中國，並親手交給官員們。
1603年12月10日，奎瓦坐上前往澳門的船隻，他此次前行的目的主要有兩個：
一是、刺探中國對菲律賓屠殺一事的看法；
二是、寫幾封函件的副本，在其中寫明華人起義的詳細過程，並拜託澳門的葡萄牙人轉交給中國官員。但因為，西班牙和葡萄牙是競爭對手，所以，葡萄牙一直都沒有把這些函件交給中國。
1604年2月，海上發生了一場風暴，奎瓦不得不暫返馬尼拉。幾天後，奎瓦帶著一百五十多名西班牙阿兵哥和一比特神父一起再次前往澳門。很快，奎瓦等人抵達澳門的消息傳到了漳州。
一些經常奔波於漳州和馬尼拉的中國商人，在澳門和奎瓦見面，並答應把函件交給中國官員，並且，鼓勵華僑前去菲律賓貿易。接下來幾天，奎瓦都在澳門刺探中國對西班牙屠殺行動的看法。通過多方途徑，他瞭解到中國政府已經得知了屠殺行為，但中國人卻沒有任何反應，也沒有集合海軍進攻馬尼拉。
得知這一重要軍情後，奎瓦在澳門購買了一批軍資，便返回了馬尼拉。當奎瓦向西菲當局說明情况後，當局的壓迫感瞬間减少了許多，他們開始期盼中國商船的到來。但是，直到1605年5月，西班牙人渴望的中國商船依然沒有來。反而，澳門那邊傳來消息說：中國已經召集了一支軍隊，準備來馬尼拉詰責。
對此，西班牙人恐懼不已。
實際上，雖然明朝已經知道了事情的真相，但是，卻一直把移居國外的華人視為“賤民”。所以，朝廷僅寫了一份檄文《諭呂宋檄》，讓一名中國商船的船主帶到馬尼拉，交給菲律賓政府和教會。
在這份《諭呂宋檄》裏，明政府並沒有對西班牙的屠華行為加以譴責，《諭呂宋檄》的全部要求，最後歸結為“放還被禁商民和被劫財物。”“若前（屠殺）事訛傳，未有兵革，投款效順，商舶往來，交貿如故；若果有嫌恨，已相仇殺，可將該島所有漳泉遺民子孫，追斂各夷劫去財貨，資送還郡，白此商舶交易仍聽往來如故。”並且，還說道：“只要西班牙殖民者從今以後保證華人在菲律賓的一切合法權利，那麼，大明朝就不會對西班牙加以懲罰，並要求西班牙感謝中國皇帝的寬宏大度和中國的仁義。”
囙此，可以認為，明廷通過發出《諭呂宋檄》所作的交涉，只是例行公事、官樣文章，其目的僅是借此對內敷衍死難者家屬及僑鄉的要求，好有個交代，對外挽回和保持大國的面子而已！其實，明朝廷之所以沒有出兵攻打馬尼拉，是因為客觀條件的限制。因為，當西班牙屠殺華人的時候，明朝廷進行了三次大規模的戰爭：西北寧夏之戰、西南播州一戰以及與日本長達七年的朝鮮戰爭。雖然，在這些戰爭中明朝都是勝利方，但這三場戰爭卻大大消耗了國家的軍事力量和新增了財政支出，尤其是與日本的對戰。
囙此，考慮到種種因素，明朝並沒有出兵馬尼拉。但是，在西班牙殖民者看來，明朝廷的態度是默許了他們的做法。於是，西班牙殖民者對旅菲華僑更是大力欺壓。1639年，華僑們實在容忍不了這種折磨，再次聯合起來發動起義。在這次起義中，華僑們堅持了將近四個月。
同時，西班牙也被華僑們逼到了絕路，並最終又陷入到了殺戮的困境，無數的華人和天主教徒死在了西班牙的屠殺行動下。在知道了旅菲華僑的狀況後，1657年，鄭成功寫了一封信給居住在爪哇島的一名華僑。在信中，鄭成功明確要求：華僑停止與西菲當局的貿易往來，並表示他將親自帶兵去攻打菲律賓，以此作為對西班牙屠殺行為的懲罰。1662年，鄭成功攻佔臺灣後，立刻派人致函給菲律賓總督，要求其馬上停止屠殺華僑的行為，並對自己犯下的過錯作出反省。然而，面對鄭成功的譴責，西班牙人不僅沒有停止罪行，反而愈演愈烈，進行了第三次對旅菲華人的大屠殺。
這次種族絕滅式的大屠殺，究竟死多少華僑，說法不一：
《明史》說是兩萬五千人，福建巡撫致阿庫那的信件說是三萬多人；
當時某些西班牙強盜估計為兩萬三千人，現代西方歷史學家多數都接受這個估計。但是，當時的西班牙強盜中就已有人對這個估計表示懷疑了，他們說：“被殺的華僑人數還要大得多。”鄭成功得知此事後十分生氣，他一邊安撫從菲律賓逃到了臺灣的華僑，一邊召集軍隊，准備進攻菲律賓。一時之間，菲律賓動盪不安，每個人的臉上都是深深的恐懼和絕望。與此同時，荷蘭的崛起更是嚴重威脅著西班牙在菲律賓的地位。這下子，西班牙殖民者感受到了來自各方的巨大壓力。
於是，他們開始計畫撤離菲律賓一事。但最終，鄭成功並沒有出兵菲律賓，因為，國家發生了內亂。且沒過多久，鄭成功就因病去世了，他的兒子鄭經接管臺灣，同時派人與西班牙當局交涉。根據史册的記載，在1670年到1671年這段時間裏，鄭經曾兩次想出兵馬尼拉。
但是，都因為現實條件的限制沒能成功出兵。