一、採收
一般於霜降至立冬採收。以管狀花（即花心）散開2/3時為採收適期，若將全部開放的花朵采下後加工質量差。採收菊花要選晴天露水幹後進行，否則容易腐爛、變質、色遜、質差。
二、加工菊花品種繁多，各地均有獨特的傳統加工方法。
1、亳菊
在花大部分盛開齊放、花瓣普遍潔白時，連莖稈割（折）下，分二、三次收完。紮成小捆，倒掛於通風乾燥處晾乾3至4周，不能曝曬，否則香氣差。乾燥快的色白，乾燥慢的為淡黃色，至花有八成幹時，即可將花摘下，置熏房內用硫磺熏白。熏後再攤曬1天即可乾燥。然後裝入木板箱或竹簍，內襯牛皮紙，1層菊花一層紙相間壓實貯藏。一般畝產50千克，高產達150千克。
2、滁菊
菊花采後陰乾、熏白，曬至六成幹時，用竹篩將花招篩成圓球形，再曬至全幹即成。曬時切忌用手翻動，可用竹筷輕輕翻動晾曬。
3、貢菊
菊花采後置烘房內烘焙乾燥，以無煙的木炭作燃料。烘房溫度控制在40至50℃之間。烘時將貢菊攤在竹簾上，當第1輪菊花烘至九成幹時，再轉為第2輪。第2輪的溫度較第1輪低，約30至40℃。當花色烘至象牙白時，即可從烘房內取出，再置通風乾燥處陰至全幹。此法加工菊花，清香而有甘味，花色鮮豔而又潔白，且揮發油損失甚少，較曬熏、蒸法加工質量為好。尤其是採用硫磺薰蒸，菊花被硫和硫化物污染，嚴重影響藥菊的質量和衛生。
4、杭菊
杭菊花加工採用燒柴的小灶蒸花的辦法。鐵鍋外緣直徑50多釐米，把菊花鋪放在蒸花盤內（蒸花盤用竹篾編成，周邊斜上，添約5釐米，上緣直徑約37至39釐米），厚約3釐米，過厚不易蒸好。鍋水燒開後，放入2至3只蒸花盤，上蓋木鍋蓋。蒸花火力要猛而均勻，每蒸一次加一次熱水。鍋水不宜過多，以免水沸到蒸花盤，影響菊花質量。蒸的時間約4至4.5分鐘，過生過熟過頭成“濕腐狀”，不易曬乾；蒸的時間過短，則出現生花，剛出籠時花瓣不貼伏，顏色灰白，經風一吹則成紅褐色。過久花熟都影響質量。蒸好的菊花放在竹簾上曬，菊花未幹不要翻動，晚上收進室內不能壓，曬3天后翻身一次，約曬6－7天后，收起貯藏數天以後再曬1－2天，花心完全變硬即可貯藏。