荸薺入藥，歷史悠久，自古入藥。中醫認為，荸薺性味甘、寒，具有清熱化痰、開胃消食、生津潤燥、明目醒酒的功效，臨床適用於陰虛肺燥、咳嗽多痰、煩渴便秘、酒醉昏睡等症的治療。在呼吸道傳染病流行季節，吃荸薺有利於流腦、麻疹、百日咳及急性咽喉炎的防治。中醫臨床上常用馬蹄配成“雪羹湯”清熱去痰，降血壓和治療大便幹硬。
降壓作用：荸薺汁加鮮藕汁、梨汁、鮮蘆根汁、麥冬汁一起，稱為“五汁飲”，用於生津消熱、降低血壓。
治食道癌：荸薺10只，帶皮蒸煮，每日服食。
治咽喉腫：荸薺絞汁冷服，每次125克。
預防流感：鮮荸薺250克，甘蔗1根，切段，入鍋煎煮，熟而食之，有清熱消炎，生津止渴之效，適於發熱後期之心煩口渴和低燒不退，還可預防流感。
通腸利便：荸薺500克，煮熟搗爛，加鹽、薑、豆粉，擠成丸子，油炸後撈起。生粉勾芡成鹵，澆在丸上，味鮮滑口，可消食開胃，利腸通便。
治痔瘡：痔瘡患者常食荸薺也大有益處。
輔助治療癌症：薺還含有防治癌症的有效成分，臨床中多用於肺癌、食道癌、乳癌，是很好的輔助治療食品。
降燒：荸薺是寒性食物，有清熱瀉火的良好功效。既可清熱生津，又可補充營養，最宜用於發燒病人。它還具有凉血解毒、利尿通便、化濕祛痰、消食除脹等功效。
麻疹不透：荸薺或蘆根煮水代茶，可助麻疹早發，早回。並可防止產生併發症。
雞眼：荸薺六枚，蕎麥十二粒，每晚以溫水洗腳後，先用針尖輕輕剔雞眼（不要深剔），去其浮污，將二粒蕎麥，放入口中，以門牙咬碎，去其柔嫩之黑皮，以指頭將蕎麥面塗在雞眼裡，填平雞眼，再少抹點口液，潤在蕎麥上。另以洗淨的荸薺，切成如雞眼大小如銅幣厚，貼在雞眼的蕎麥面上，以薄布包好，以免散落，如此特續一星期，雞眼會不知不覺的消失，此法屢試屢驗，頗具奇效。
急性腎炎：鮮荸薺苗（通天草）一兩（幹品四錢），和大腹皮五錢，水煎服，除可治腎炎，對浮腫的消除也有效。
白內障：用荸薺搗汁滴眼，可以達到退翳的功效。
風火赤眼（急性結膜炎）：鮮荸薺洗淨去皮，搗爛，以紗布絞汁，加食鹽少許洗眼晴。
腎結石：1、將生荸薺的皮削掉，每天生吃一至三斤，此法專治酸性腎結石有效。2、荸薺、包穀穗子、化石草（又名真管草）煎水代茶喝，治各種結石症，均有效。