三藩之亂，是中國歷史上清朝初期，三個藩鎮王發起的叛亂事件。三藩是指平西王吳三桂、平南王尚可喜、靖南王耿精忠。
清廷入關後需要對付李自成農民軍和南明政府的反抗，明朝的降官是可以借助的力量。但20年後，南方駐雲南的吳三桂、駐廣東的尚可喜、駐福建的耿精忠等藩王已經形成很大的勢力，與清廷分庭抗禮。其中吳三桂勢力最大，不僅在經濟上是中央政府沉重的負擔，而且威脅到清政權。
1673年（康熙十二年）春，康熙皇帝作出撤藩的决定。吳三桂首先於這年11月殺雲南巡撫朱國治，自稱天下都招討兵馬大元帥，提出“興明討虜”，將矛頭指向朝廷。吳三桂軍由雲、貴而開進湖南，幾乎佔據湖南全省。進而佔據四川，四川官員紛紛投降。福建、廣東、廣西、陝西、湖北、河南等地都有藩王或將領響應。
吳三桂在湖南沿江佈置防禦工事，不敢再向北發展，康熙帝抓住機會調整戰畧、安排兵力。
他首先堅決打擊吳三桂，而對其他的反叛者卻實行招撫，通過分化力量而孤立吳三桂。軍事上僅以湖南為進攻的重點，同時能够充分信任漢將，這樣就鼓舞了朝廷軍隊的士氣。
在耿精忠、尚之信歸順清廷之後，吳三桂於1678年（康熙十七年）在衡州稱帝，立國號周，建元昭武，大封諸將。其實這時的吳三桂已到了窮途末路。他積鬱而死後，將所謂的“帝位”傳給孫子吳世璠。
1681年（康熙二十年）冬，清軍進入雲貴省城，吳世璠自殺，歷時8年的三藩之亂被平定。對於清廷來說，是確立穩定的皇朝統治的標誌。