澱粉樣的產物和它在組織中沉積的原因尚不清楚，在不同的澱粉樣變性生化類型中，病因學機制可能會不同，例如，繼發性澱粉樣變性為蛋白前體的代謝障礙（急性期反應物血漿澱粉樣A），而遺傳性的澱粉樣變性會出現不同的蛋白，在原發性澱粉樣變性中，骨髓細胞的單尅隆群會產生能形成澱粉樣變性的片段或整個長鏈，在光學顯微鏡下，澱粉樣是同源性，高親和性，在固定的組織中和剛果紅染料有親和的物質，在電子顯微鏡下，它由100Å；（10nm）線型無支纖維組成，在X線繞射下，它是交叉的β線。
現已普遍認識到三種主要的系統性臨床形式，當澱粉樣變性和疾病無關時被稱為原發性或突發性（AL形），當和慢性疾病有關時被稱為繼發性，獲得性或反應性，這或為感染性（結核，支氣管擴張，骨髓炎，麻風）或為炎性（類風濕性關節炎，肉芽回腸炎），澱粉樣變性亦和多發性骨髓瘤，霍奇金病（AA），其他腫瘤及家族性地中海熱有關。以家族形式出現的Ⅲ型和其他疾病無關。
在原發性澱粉樣變性，心，肺，皮膚，舌，甲狀腺和腸道常受累，在呼吸道和其他部位可發現局限化的腫塊，實質性器官（肝，脾，腎）和心血管系統，特別是心臟常受累。
繼發性澱粉樣變性顯示脾，肝，腎，腎上腺和淋巴結受累，儘管少有心臟受累的臨床體征，但心血管系統常廣泛受累，腎臟常有擴大，肝脾常腫大，質地變硬，呈橡皮樣。由於正常的脾小體被白色的澱粉樣變性所取代，脾增大，呈半透明狀蠟樣，稱為“西米”脾。
遺傳性澱粉樣變性以周圍感覺和運動神經（常是自主神經）和心血管及腎臟澱粉樣變性為特徵。常存在腕管綜合征和玻璃體不正常。
和某些惡性疾病（如多發性骨髓瘤）有關的澱粉樣變性與特發性的澱粉樣變性分佈一樣；和另外一些惡性疾病有關的澱粉樣病變（如甲狀腺髓樣瘤）僅和腫瘤或它的轉移有關。成年期發作的糖尿病常在胰腺中發現有澱粉樣變性。