肝硬化由於門脈壓力增高，腹水形成等多種因素的存在，很多病人腸道血液回流不通暢，造成腸壁充血，水腫，影響食物和水分的吸收。吸收不良則導致多種腸道內容物從大便排出，形成腹瀉，此為消化不良性腹瀉；膽汁是協助脂肪消化吸收的重要物質。肝硬化時多有膽汁的分泌和排泄不足，勢必會影響到脂肪的消化吸收，大量不能吸收的油膩物質會連同其他腸道內容物很快排出體外，造成脂肪性腹瀉；肝硬化病人腸道防禦能力减退，抵抗外來致病微生物的能力降低，容易發生腸道內病毒，細菌，寄生蟲感染，稱之為感染性腹瀉；正常情况下腸道記憶體在一些細菌，稱為腸道正常菌群。他們相互之間維持一種動態平衡，正常情况下不會引起腸道感染性病變，並且可以“抗衡”外來的致病菌。肝硬化時由於多種因素導致的腸道內環境的改變，造成腸道內正常菌群相互之間的動態平衡失調。當某一種細菌佔優勢時，“正常細菌”也會引起發病，稱為“機會性感染”另外，這種菌群間的失衡使腸道抵禦外來感染的能力也會减退。囙此腸道致病微生物的感染是肝硬化病人腹瀉的常見原因。