1.指甲與（或）趾甲損害：常呈對稱性，但十指（趾）甲同時罹患者並不多見。甲體變薄而無光澤，按壓時有凹陷，有時在甲床顯示紅色針尖樣小點，壓診疼痛。甲體表面可以表現為細鱗縱溝、點隙、切削面（狀如被利刃削去一層而呈平面）。嚴重的指、趾甲損害可使甲體脫落，還可發生潰瘍壞死。某些病例除指（趾）甲損害外還可發生脫髮。
2.皮膚損害：扁平苔蘚是許多苔蘚類皮膚病中的一種，損害特點為扁平面有光澤的淺紫紅色多角形丘疹，丘疹如綠豆大小，邊緣境界清楚，質地堅硬乾燥，融合後狀如苔蘚。損害區粗糙，丘疹間可見皮膚皺褶，由於瘙癢故多有搔痕。以石蠟油塗在丘疹表面，在放大鏡下觀察可看到細白紋，稱Wickham紋。皮膚損害的治療效果一般較粘膜者為優。
3.口腔粘膜損害：主要特徵為珠光白色條紋。白紋可以向各個方面延伸，整個線條不被紅紋“切割”，凡白紋稠密時可交織成網狀，稀少時可呈樹枝狀，也可為單線條或繞成環形。類型雖多，但分型並無重要臨床意義。損害往往具有明顯的左右對稱性，粘膜柔軟，彈性正常，但有粗糙感，輕度刺激痛。
（1）網狀損害：較多見於磨牙區粘膜與前庭溝，常自後向前蔓延，損害區粘膜的柔性與彈性基本正常。病人自覺粘膜表面粗糙，口唇活動時受牽拉與進食時有輕度刺激痛等，這也是同白色角化病的區別。由於扁平苔蘚的主要病理改變是基底細胞液化變性與固有層大量炎症細胞浸潤，所以在白紋稠密區域，特別是在前庭溝與頰粘膜區域較多發生充血，並形成上皮下水皰。水皰極易破裂而迅速成為淺錶糜爛，通常經局部治療，糜爛即可癒合而白紋重新出現，所以這種局限性糜爛，僅僅是本病的一種階段性表現，而不是本病的一種特定類型。白紋稀少區域通常也少發生糜爛。單線條可發生在前庭溝、口底舌腹界、唇紅與附著齦，環形偶見於頰粘膜。
（2）丘疹：狀如針頭大小，微隆，偶見於伴白紋的頰粘膜，但不應與皮脂腺異位症（Fordyce disease）相混淆，因為這二者可以同時存在。异比特皮脂腺呈淡黃色顆粒，可以叢集或散在，除了非常淺錶的外，一般都隱伏於粘膜下，也無自覺症狀。唇紅部也是异比特皮脂腺的好發區域，一般上唇多見於下唇。
（3）斑塊：圓或橢圓形多見，常位於舌背中份或兩側，基本上保持對稱，但也可為單側性。損害區乳頭消失而平伏。方塊型偶見於有吸烟史者的頰粘膜與（或）附著齦，實際上是一種少見的白色角化病，故戒烟後斑塊逐漸消失而白紋重現。
（4）水皰：一般為粟粒狀，多見於軟齶，但也可發生於其它部位。水皰容易破裂，在一晝夜間又重新出現。
（5）糜爛：糜爛型常見，範圍相當廣泛，幾乎可遍及整個口腔粘膜。雖然，在某些區域尚可隱約顯示白紋樣損害，由於沒有典型表現，故不能為臨床提供診斷依據。附著齦的糜爛常可見殘留的皰壁，狀如“上皮剝脫”，這種具有剝脫性的臨床表現可見於多種炎症性疾病（天皰瘡、類天皰瘡等），所以舊稱“剝脫性齦炎”，現在已不作為獨立存在的疾病。本型對於抗生素與免疫抑制劑治療常具有對抗性，必須進行全面的系統性檢查，以免貽誤診斷與治療。
4.生殖器粘膜損害：常呈暗紅色的圓或橢圓形斑塊，表面可見白色網狀損害，容易發生糜爛。