一、發性舌咽神經痛：原發性舌咽神經痛的病因仍不清楚，可能是神經脫鞘所致。發病年齡多在四十歲以上，男性多於女性。其臨床表現特點：
1.臨床表現與疼痛部位：與原發性三叉神經痛不同，疼痛發生在一側舌根、咽喉、扁桃腺、耳根部及下頷後部，有時以耳根部疼痛為主要表現。
2.發作情况和疼痛性質：同三叉神經痛、疼痛通常驟然發作、突然停止，每次發作持續時間多為數秒或數十秒，一般不超過兩分鐘。亦可呈刀割、針刺、撕裂、燒灼、電擊樣劇烈疼痛。
3.誘發因素：常於吞咽、說話、咳嗽或打哈欠時誘發疼痛。
4.板機點：往往有板機點，部為多在咽後壁、扁桃體、舌根等處，少數可在外耳道。
5.其他症狀：吞咽動作常會誘發疼痛發作，雖然發作間歇期無任何异常，但懼怕誘發疼痛而不敢進食，患者常有消瘦、脫水、喉部痙攣感、心律不整及低血壓性昏厥等症狀。
6.神經系統檢查：正常。
二、繼發性舌咽神經痛：某些小腦腦橋角腫瘤、蜘網膜炎、血管性疾病、鼻咽部腫瘤或莖突過長症等均可激惹舌咽神經而引起舌咽神經分部區域的疼痛，稱為繼發性舌咽神經痛。其臨床表現為：
1.舌咽神經分部區域疼痛。疼痛發作持續時間長或持續性，誘發因素及板機點不明顯，夜間為重。
2.鄰近腦神經痛。可出現頸靜脈孔症候羣及Horner徵候；亦可有小腦腦橋角症候羣出現。
3.若鼻咽癌所致，可在鼻咽部發現腫塊，頸部淋巴結腫大。原發性舌咽神經痛同原發性三叉神經痛的治療方法相似，可用藥物及神經阻斷術治療，但開顱手術治療效果最佳。