（1）淋巴結轉移：頸部淋巴結約占全身淋巴結的13%，特別是深層淋巴結與腫瘤轉移關係密切。鼻咽癌有頸部淋巴結轉移早、轉移率高的特點。轉移淋巴結常是多個、大小不等、質硬的腫塊，一般隨病程進展由小到大，數量增多，逐步融合為巨大腫塊，活動度逐步受限。通常轉移由上頸部到下頸部，約一半患者有雙頸轉移，耳前淋巴結轉移則較少見。
（2）遠處轉移：鼻咽癌遠處轉移率較高，與原發腫瘤是否侵犯鼻咽腔外、頸淋巴結是否有轉移以及大小、部位有明顯關係。腫瘤侵犯口咽或鼻腔的遠處轉移率較高。轉移部位可以是單處也可以是多處。常見遠處轉移的部位為骨、肺、肝。而骨轉移中以脊柱、骨盆和四肢多見。亦可發生胸腔、腹腔、縱隔淋巴結、腹股溝淋巴結等部位的轉移。CT檢查可以早期發現腎臟、腎上腺和腹膜後等區的轉移。