鼻咽癌在臨床上主要表現為：
1.上頸部淋巴結無痛性腫大：約80%的病人會在下頜骨與耳朵下方部位出現淋巴結無痛性腫大。因鼻咽腔位於身體中線部位，所以患者的左右頸部都可能出現淋巴結轉移。
2.鼻部症狀：包括鼻涕中有血絲、痰中有血絲，或講話出現鼻音、鼻子呼吸困難。痰中帶有血絲常見於早上第一口痰，因為腫瘤組織的微量出血，可沿著咽喉部向下流動與痰混和，出現在第一口痰中，以後反而不容易見到。講話出現鼻音是由於腫瘤向前生長，侵犯鼻腔引起聲音共鳴改變而出現鼻音。有時腫瘤太大，堵塞了鼻腔，造成呼吸困難，則需要張口呼吸。
3.耳部症狀：這是因為腫瘤壓迫、阻塞鼻咽腔側壁的耳咽管，引起耳鳴、中耳積水、聽力受損，多發生在單側。
4.頭痛：單側太陽穴部或後腦部疼痛最常見，這是由於腫瘤向上侵犯顱骨底部，破壞骨頭而導致的持續性的疼痛。
5.腦神經症狀：腫瘤侵犯到顱內的腦神經而引起不同的症狀，如複視、臉頰部位麻痛、吞咽動作不暢容易嗆到、舌頭運動不良以及腫瘤轉移到不同部位而引起的相應症狀。鼻咽癌還容易轉移到骨骼、肝臟及肺臟等處而引起不同的相關症狀。