由於羊水生成及迴圈機制尚未完全闡明，有不少羊水過少的病例原因不明，臨床多見下列情况。
1.胎兒畸形如胎兒先天性腎缺如、腎發育不全、輸尿管或尿道狹窄等畸形致尿少或無尿而引起羊水過少。
2.過期妊娠過期妊娠時，胎盤功能减退，灌注量不足，胎兒脫水，導致羊水少。也有學者認為過期妊娠時，胎兒過度成熟，其腎小管對抗利尿激素的敏感性增高，尿量少導致羊水過少。由過期妊娠導致羊水過少的發生率達20%～30%。
3.胎兒宮內發育遲緩（IUGR）羊水過少是胎兒宮內發育遲緩的特徵之一，慢性缺氧引起胎兒血液迴圈重分配，主要供應腦和心臟，而腎血流量下降，胎尿生成减少而致羊水過少。
4.羊膜病變電鏡觀察發現羊膜上皮層在羊水過少時變薄，上皮細胞萎縮，微絨毛短粗，尖端腫脹，數目少，有鱗狀上皮化生現象，細胞中粗面內織網及高爾基複合體也减少，上皮細胞和基底膜之間橋粒和半橋粒减少。認為有些原因不明的羊水過少可能與羊膜本身病變有關。