傳染性軟疣為世界流行性疾病，本病在巴布亞、新幾內亞、斐濟等兒童中發病率最高。在西方，本病發病率上升並與生殖器皰疹、梅毒和淋病的發病增多相平行。據Willcox報導，1971～1973年男性傳染性軟疣新增了29.6%，女性新增了25.0%。我國上海華山醫院皮膚科報導，本病主要常見於兒童。
本病可在公共浴池、游泳池或通過性接觸傳染，性接觸傳染主要見於性活躍的青年人，常與***有關，故認為是一種性病，其依據有：①軟疣皮損多發生於生殖器或鄰近部位，同性戀者其皮損好發於肛周；②性伴之間軟疣發病率較高；③上述性活躍人群中常伴發其他性病。本病很少發生於老人，最近報導有見於AIDS患者。如存在易感因素，對此病毒比較敏感者，損害易泛發，有報導在結節病、白血病、使用皮質類固醇及免疫抑制劑者，可發生廣泛的皮損。黑猩猩、袋鼠及馬可自然感染。