脂肪肝的臨床表現多樣，輕度脂肪肝多無臨床症狀，易被忽視。據記載，約25%以上的脂肪肝患者臨床上可以無症狀。有的僅有疲乏感，而多數脂肪肝患者較胖，故更難發現輕微的自覺症狀。囙此現時脂肪肝病人多於體檢時偶然發現。中重度脂肪肝有類似慢性肝炎的表現，可有食欲不振、疲倦乏力、噁心、嘔吐、體重減輕、肝區或右上腹隱痛等。肝臟輕度腫大可有觸痛，質地稍韌、邊緣鈍、表面光滑，少數病人可有脾腫大和肝掌。當肝內脂肪沉積過多時，可使肝被膜膨脹、肝韌帶牽拉，而引起右上腹劇烈疼痛或壓痛、發熱、白細胞增多，易誤診為急腹症而作剖腹手術。脂肪囊泡破裂時，脂肪顆粒進入血液也可引起腦、肺血管脂肪栓塞而突然死亡。若肝細胞脂肪堆積壓迫肝竇或小膽管時，門靜脈血流及膽汁排泄受阻，出現門靜脈高壓及膽汁淤積。因急性化學物品中毒、藥物中毒或急性妊娠期脂肪肝，其臨床表現多呈急性或亞急性肝壞死的表現，易與重症肝炎相混淆。此外，脂肪肝病人也常有舌炎、口角炎、皮膚淤斑、四肢麻木、四肢感覺异常等末梢神經炎的改變。少數病人也可有消化道出血、牙齦出血、鼻衄等。重度脂肪肝患者可以有腹水和下肢水腫、電解質紊亂如低鈉、低鉀血症等，脂肪肝表現多樣，遇有診斷困難時，可做肝活檢確診。
脂肪肝常無自覺症狀，有些類似輕症肝炎，黃疸少見，如有亦為輕度。通過B超、CT可有輔助診斷意義，確診必須依靠肝活檢。