少尿期常與低血壓休克期重疊而無明顯界限。在低血壓中、後期即可出現少尿，也有人從發熱期直接進入少尿期，而表現發熱。低血壓和少尿期重疊常為重型病例。
1、少尿期的出現及持續時間：一般在病程的第5-8病日，早者第3病日，晚者第10病日，持續2-5天。
2、少尿强度：24h尿量<1000ml者為少尿傾向，<500ml者為少尿，<50ml者為無尿，有些病例少尿不明顯，但存在氮質血症，稱之為“無少尿型腎功衰竭”。
3、少尿期的臨床表現：由於腎功衰竭，腎臟排泄功能障礙，體內大量代謝物及液體瀦留，電解質平衡紊亂，出現氮質血症和/或尿毒癥，酸中毒，高血容量綜合征，如厭食噁心，腹脹，頭暈頭痛，皮膚大片淤斑，呼吸深快，心肌收縮無力，血壓下降，高血容量時出現頭脹痛，體毒V充盈，脈洪大，血壓上升，心率上升，紅細胞，血紅蛋白，壓積下降。
潜伏期為5～46天，一般為1～2周。本病典型表現有發熱、出血和腎臟損害三類主要症狀，以及發熱、低壓，少尿、多尿與恢復期等五期臨床過程。多數病例臨床表現並不典型，或某期表現突出，或某期不明顯而呈“越期”現象，或前兩、三期重疊。
（一）發熱期：主要表現為感染性病毒血症和全身毛細血管損害引起的症狀。
大多突然畏寒發熱，體溫在1～2日內可達39～40℃，熱型以弛張及稽留為多，一般持續3～7日。出現全身中毒症狀，高度乏力，全身酸痛，頭痛和劇烈腰痛、眼眶痛，稱為“三痛”。頭痛可能與腦血管擴張充血有關；腰痛與腎周圍充血、水腫有關；眼眶痛可能為眼球周圍組織水腫所致。胃腸道症狀也較為突出，常有食欲有振、噁心、嘔吐、腹痛及腹瀉等。重者可有嗜睡、煩燥及譫語等。但熱度下降後全身中毒症狀並未減輕或反而加重，是不同於其他熱性病的臨床特點。
顏面、頸部及上胸部呈彌漫性潮紅，顏面和眼瞼略浮腫，眼結膜充血，可有出血點或瘀斑和球結合膜水腫，似酒醉貌。在起病後2～3日軟齶充血明顯，有多數細小出血點。兩腋下、上胸部、頸部、肩部等處皮膚有散在、簇狀或搔抓狀、索條樣的瘀點或瘀斑。重者的瘀點、瘀斑可遍及全身，且可發生鼻衄、咯血或腔道出血，表示病情較重，多由DIC所致。
（二）低血壓期：主要為失血漿性低血容量休克的表現。
一般在發熱4～6日，體溫開始下降時或退熱後不久，患者出現低血壓，重者發生休克。可全並DIC、心力衰竭、水電解質平衡失調，臨床表現心率加快，肢端發凉，尿量减少，煩燥不安，意識不清，口唇及四肢末端發紺，呼吸短促，出血加重。本期一般持續1～3日，重症可達6日以上。且常因心腎功能衰竭造成死亡，此期也可不明顯而迅速進入少尿或多尿期。
（三）少尿期：少尿期與低血壓期常無明顯界限，二者經常重疊或接踵而來，也有無低血壓休克，由發熱期直接進入少尿期者。24小時尿少於400ml為少尿，少於50ml者為無尿。本期主要臨床表現為氮質血症，水電解質平衡失調。也可因蓄積於組織間隙的液體大量回入血循環，以致發生高血容量綜合征。
本期多始於6～8病日，血壓上升，尿量銳減甚至發生尿閉。重者尿內出現膜狀物或血尿，此期常有不同程度的尿毒癥、酸中毒及電解質紊亂（高鉀、低鈉及低鈣血症等）的表現。伴有高血容量綜合征者，脈搏充實有力，靜脈怒張，有進行性高血壓及血液稀釋等。重者可伴發心衰、肺水腫及腦水腫。同時出血傾向加重，常見皮膚大片瘀斑及腔道出血等。本期一般持續2--5日，重者無尿長逾1周，本期輕重與少尿和氮質血症相平行。
（四）多尿期：腎臟組織損害逐漸修復，但由於腎小管回吸收功能尚未完全恢復，以致尿量顯著增多，24小時尿量達3000ml為多尿，多尿達4000～10000ml以上。
多尿初期，氮質血症、高血壓和高血容量仍可繼續存在，甚至加重。至尿量大量新增後，症狀逐漸消失，血壓逐漸回降。若尿量多而未及時補充水和電解質，亦可發生電解平衡失調（低鉀、低鈉等）及第二次休克。本期易發生各種繼發感染，大多持續1～2周，少數長達數月。
（五）恢復期：隨著腎功能的逐漸恢復，尿量减至3000ml以下時，，即進入恢復期。尿液稀釋與濃縮功能逐漸恢復，精神及食欲逐漸好轉，體力逐漸恢復。一般需經1～3月恢復正常。
（六）臨床分型：按病情輕重可分為四型：
1.輕型①體溫39℃下，中毒症狀輕；②血壓基本正常；③出血現象少；④腎損害較輕，尿蛋白在“＋～＋＋”，無明顯少尿期。
2.中型①體溫在39～40℃，中毒症狀較重，外滲現象明顯；②收縮壓低於12.0Kpa（90mmHg），或脈壓小於3.5Kpa（26mmHg）；③皮膚、粘膜出血現象明顯；④腎損明顯，尿蛋白可達“卅”，有明顯少尿期。
3.重型①體溫≥40℃，全身中毒症狀及外滲現象嚴重，或出現中毒性精神症狀；②收縮壓低於9.3Kpa（70mmHg）或脈壓小於3.5Kpa（26mmHg）；③皮膚、粘膜出血現象較重。如皮膚瘀斑、腔道出血；④腎損嚴重，少尿期持續在5日以內或尿閉2日以內者。
4.危重型在重型基礎上，出現以下任何嚴重症候羣者。①難治性休克；②出血現象嚴重，有重要臟器出血；③腎損極為嚴重，少尿超過5於以上，或尿閉2天以上，或尿素氮超過120mg/dl以上；④心力衰竭、肺水腫；⑤中樞神經系統合併症；⑥嚴重繼發感染。
（七）家鼠型出血熱的臨床特點：
與野鼠型相比，家鼠型輕型較多，五期經過多不全。發熱期較短，熱退多數病情減輕，困倦衰竭少見，腰痛及眼眶痛不顯著，消化道症狀較輕；低血壓期與少尿期輕或無；多尿期與恢復期亦較短；出血、腎損與滲出水腫均較輕；合併症少，但肝臟受損較野鼠型明顯，病死率低。