（一）、飼料成本：飼料在甲魚養殖成本中所占的比例最大，按現在的飼料、養殖技術水准一般飼料係數在1.5~1.7，飼料平均按11元計，每生產一斤商品甲魚飼料成本在8.3~9.4，由於近年來魚粉資源越來越短缺，尤其是甲魚飼料中所用的魚粉主要以優質的白魚粉為主，使得甲魚使用的飼料價位始終高居不下，是養殖甲魚首要面對的問題；
（二）、苗種成本：苗種成本在甲魚養殖成本中所占比例相對較高，按2007年進貨價計，臺灣苗平均約2.5元/只，湖南苗平均約3.5元/只，按上市率80%、平均每只一斤計，苗種成本臺灣苗種成本平均約3.13元/斤，湖南苗種成本平均約4.38元/斤；
（三）、藥品成本：藥品包含內服部分及外用部分，內服部分主要有平時額外添加的多元、葡萄糖等保健食品、口服搞生素等；外用部分包括水質調節劑、生物製劑、外用清塘消毒藥等。一般每生產一斤商品甲魚成本約為0.8~1.0元；
（四）塘租：一般塘租成本在1元/斤；
（五）池塘折舊：以每斤0.5元計
（六）人工水電：一般人工水電成本在1元/斤；
成活率高低是效益好壞的關鍵，要提高成活率就要做到認真細緻，精心管理。首先，在放種前一定要做好清塘消毒工作，進行體外消毒。其次，要搞好水質調控，營造一個良好的生態環境，使甲魚健康成長。
甲魚養殖有前景嗎？
1、從消費市場看
十年前，食甲魚是相當高層次的消費，在東部沿海發達地區大規格高品質的甲魚能够獲得消費者的認可，甲魚產品出口和作為保健食品等的需求量也非常大。此外，據調查僅四川一省，在淡季時甲魚消費每天就有90噸。現時許村人經營的溫室甲魚主要銷往南京、杭州、上海等地，三地批發市場日銷售數量分別達到125噸、75噸和50噸，市場消費量巨大。
2、從經濟效益來看
根據近年來的甲魚發展情況和消費者需求，對未來三年的行情比較看好。一則人們對甲魚的營養價值越來越認可，喜歡吃甲魚的人越來越多；二則甲魚的質量安全越來越可靠，甲魚市場進入穩定發展期，養殖技術日趨完善，市場銷售穩定。
二、甲魚養殖存在的一些制約和困難
1、甲魚銷售價格波動較大，養殖風險日益加大
2008年時甲魚行業走入低谷，甲魚平均價格只有12元左右/斤，而到2011年甲魚行業重新回暖，平均達到了23元/斤以上，到2012年價格又回落到18元/斤左右。市場價格的大幅振盪使甲魚養殖行業從高利潤行業轉入高利潤與高風險並存的行業。
2、甲魚養殖環境污染亟待解决
由於溫室甲魚全年均以封閉式高密度養殖，一年中殘存飼料及甲魚本身新陳代謝的產物積累等全滯留在養殖水體內，甲魚出售之時將養殖池內全部污染物隨水體排出，造成部分河道水體終年呈棕黃色，河床淤積嚴重，當溫度上升之時水質發黑髮臭，嚴重影響河道水質及附近居民的身體健康。
甲魚池塘人工養殖技術有哪些？
1.關於甲魚苗的投放密度上面有講到過，主要是根據魚苗的大小來確定，小的就密一些，大就稀疏一些就可以了。
2.飼料投喂是甲魚養殖過程中的重要環節，只有根據鱉的生長階段、健康狀況投喂不同配方的自配飼料，才能最大限度滿足甲魚健康生長的需要。一般溫室養殖的甲魚以投喂配合飼料為主，池塘養殖商品魚以喂鮮活動物性飼料為主。
3.甲魚養殖池裏的水要定期排污，每次換掉1/3左右，有田間的可以定期進行消毒。
4.在甲魚養殖過程中要注意紅脖子病、白斑病、累枝蟲病和腐皮病等，對於染病的甲魚及時治療，並對池塘進行消毒，加强日常巡邏，及時發現及時採取措施。